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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001317`

染色体: Chr03 坐标: 15449509-15450816 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001317`
名称	SmilChr03G001317
描述	uncharacterized SmilChr03G001317
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15449509 - 15450816 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018436`
GeneID	`131018436`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018436`
原始查询	`SmilChr03G001317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=37.9; qcov=0.995; evalue=7.79e-91; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=33.8; qcov=0.545; evalue=2.96e-32; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018436

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803142.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803142.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803142.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803142.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15449553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr3:15449620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:15449696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:15449718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A7,D5
`Chr3:15450414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:15450502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B139,D1
`Chr3:15450729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A21,A25,B113,B121,B123,B127,B128,B27,B29,B37,B38,B39,B41,B49,B55,B56,B63,B66,B69,B75,B78,B80,B81,B87,B95,C11,C20,C26,C29,C38,C39,C54,C58,C62,C7,C70,C71,C79,C81,C85,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803142.1

435 aa

218

435

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 348-406 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803142.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	348	406	9.8e-10	38.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947159.1
ATGAGAGGAGAATGGCATGGTTTGCAGACTCTATTTTTGAATGAGTGCCCGTATGCATATTACATTCATTGTTTCGCTCATCGACTACAGCTGATATTAGTTGCTACATCTCAAAAAGTTATTCCTATTGAGCACTTTTTTTCCCAGCTTCTTATTATTATTAATGTAGTTGATTCTTCTGCGAAGCGCCATGATCAACTGCAAATTGCGCAGGCTATTCGAATTGAAGAGTTGACTTCAACCAATCAGCTTGAAACTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018436
ATGAGAGGAGAATGGCATGGTTTGCAGACTCTATTTTTGAATGAGTGCCCGTATGCATATTACATTCATTGTTTCGCTCATCGACTACAGCTGATATTAGTTGCTACATCTCAAAAAGTTATTCCTATTGAGCACTTTTTTTCCCAGCTTCTTATTATTATTAATGTAGTTGATTCTTCTGCGAAGCGCCATGATCAACTGCAAATTGCGCAGGCTATTCGAATTGAAGAGTTGACTTCAACCAATCAGCTTGAAACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803142.1
MRGEWHGLQTLFLNECPYAYYIHCFAHRLQLILVATSQKVIPIEHFFSQLLIIINVVDSSAKRHDQLQIAQAIRIEELTSTNQLETGRGKNQIGSLQRPGDTRWSSHLNSMHSLLKMFDSVLVVLGEIINDRSAASRAVADKAYDVMMSFEFAFVLHFLIDLLGRANDLCRMLQCISQDIVNAIDAVSNTKEIIQKFRENGWSGLLEKVKRFCEQRDIEIPDMNGVRRSSRGRAPNNLVTWEHHYRVDIFYGTIDCILQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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