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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001327`

染色体: Chr03 坐标: 15527280-15529619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001327`
名称	SmilChr03G001327
描述	uncharacterized SmilChr03G001327
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15527280 - 15529619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018440`
GeneID	`131018440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018440`
原始查询	`SmilChr03G001327`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821786]; symbol=AT3G22220; hit=AT3G22220; species=arabidopsis; confidence=low
产物	hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821786]; symbol=AT3G22220; hit=AT3G22220; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22220` (AT3G22220) hAT transposon superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821786] identity=29.9; qcov=0.978; evalue=1.2e-79; confidence=low
Rice	`Os09g0499600` - identity=29.4; qcov=0.835; evalue=1.65e-71; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF26664 (zf-BED_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803146.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803146.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803146.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803146.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15527351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B9,C50,C56,D5
`Chr3:15527458`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B80
`Chr3:15527458`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B80
`Chr3:15527468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:15527505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr3:15527557`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A23,B30
`Chr3:15527557`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A23,B30
`Chr3:15527562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B58
`Chr3:15527565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr3:15527581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A21,B112,B120,B123,B131,B133,B20,B28,B4,B48,B56,B58,B63,B64,B7,B76,B78,B81,B83,B95,B96,C1,C3,C32,C40,C42,C52,C57,C65,C68,C74,C82,C83
`Chr3:15527582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A21,B112,B120,B123,B131,B133,B20,B28,B4,B48,B56,B58,B63,B64,B7,B76,B78,B81,B83,B95,B96,C1,C3,C32,C40,C42,C52,C57,C65,C68,C74,C82,C83
`Chr3:15527584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803146.1

643 aa

322

643

zf-BED_2

DUF659

PF26664 zf-BED_2 26-74 aa PF04937 DUF659 219-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803146.1`	Pfam	`PF26664`	zf-BED_2	Domain	26	74	1.5e-09	38.1	BED-like zinc finger
`XP_057803146.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	219	293	2.4e-33	115.6	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947163.1
ATGAGTGGCCCACAACGAAAAGACCTTGCATGGAATTATGCAATTTCAATGGAAGTGCTGGCAAAAGGTGCAAATAAAGGATACAAATATTTGAAGTGTACATTTTGTAGCAAGGAAATCAGTGGGGGAGTTAAGAGAGTCAATGATCATTTGGGTTGCAATCACAAGAACGTGGCTCCCTGTTCACGCGTACCTGATGACTTTAAGAACTCGATGAAAGAATATTTGAGAACATTTGAGGAATCAAAACACACCAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018440
ATGAGTGGCCCACAACGAAAAGACCTTGCATGGAATTATGCAATTTCAATGGAAGTGCTGGCAAAAGGTGCAAATAAAGGATACAAATATTTGAAGTGTACATTTTGTAGCAAGGAAATCAGTGGGGGAGTTAAGAGAGTCAATGATCATTTGGGTTGCAATCACAAGAACGTGGCTCCCTGTTCACGCGTACCTGATGACTTTAAGAACTCGATGAAAGAATATTTGAGAACATTTGAGGAATCAAAACACACCAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803146.1
MSGPQRKDLAWNYAISMEVLAKGANKGYKYLKCTFCSKEISGGVKRVNDHLGCNHKNVAPCSRVPDDFKNSMKEYLRTFEESKHTKQREFDDAVDGGAYFGVDLPFPANVERGIRGPMDRFIANELEDGKVVPPSATAKEHRSRVYLDIGRFLFENAIPFNCIRSPSFISMVRSIGGYGRGLKPPSMHEMRTWILKEEVKTTSAIVDEIKATWKHTGKLFELLDEVVEEIGEEHVVQVITDNGAAYKAAERLLMDKRTSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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