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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001328`

染色体: Chr03 坐标: 15537449-15541021 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001328`
名称	SmilChr03G001328
描述	phytyl ester synthase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15537449 - 15541021 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018441`
GeneID	`131018441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018441`
原始查询	`SmilChr03G001328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytyl ester synthase 1, chloroplastic-like
产物	phytyl ester synthase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G54570` (PES1) Esterase/lipase/thioesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841899] identity=54.5; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0362100` - identity=55; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008374 (GO:0008374); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03982 (DAGAT); PF12146 (Hydrolase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057803147.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057803147.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803147.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803147.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15537490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,C15,C6,D9
`Chr3:15537538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B139,B17,B87,C54
`Chr3:15537541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:15537631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,D7
`Chr3:15537833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,D2
`Chr3:15537845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B6,C70,C71,D9
`Chr3:15539448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D9
`Chr3:15539472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B68
`Chr3:15539533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:15539605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr3:15539640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C5
`Chr3:15539688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803147.1

651 aa

326

651

Hydrolase_4

DAGAT

PF12146 Hydrolase_4 117-316 aa PF03982 DAGAT 445-523 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803147.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	117	316	2.4e-07	31.1	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057803147.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	445	523	2.1e-06	27.6	Diacylglycerol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947164.1
TCAATCCGCTTATCGCCTCCGACCTCGCTTCACAAGTCATCGACAGTAGCCGCTGCAACGAGGGAGAAGGAACTGAAGCCCCTGTGGGACGACGGGTACGGGACTCAGACAGCGAGGGACTACATTCAAGCAAGTACTAAACTTATGATCAACTCCGATGGCGGCCCGCCTCGATGGTTCTGCCCCAGCGAAGCCGGCCCACCTCTCCACAACTCTCCTCCTCTCCTCTATTTGCCTGGGATCGACGGTGTGGGGATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018441
TCAATCCGCTTATCGCCTCCGACCTCGCTTCACAAGTCATCGACAGTAGCCGCTGCAACGAGGGAGAAGGAACTGAAGCCCCTGTGGGACGACGGGTACGGGACTCAGACAGCGAGGGACTACATTCAAGCAAGTACTAAACTTATGATCAACTCCGATGGCGGCCCGCCTCGATGGTTCTGCCCCAGCGAAGCCGGCCCACCTCTCCACAACTCTCCTCCTCTCCTCTATTTGCCTGGGATCGACGGTGTGGGGATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803147.1
SIRLSPPTSLHKSSTVAAATREKELKPLWDDGYGTQTARDYIQASTKLMINSDGGPPRWFCPSEAGPPLHNSPPLLYLPGIDGVGMGMVLHHKAMGKVFRVRCMQVPTEDRTPYEELVEFVGEAVEAEHASSPDMPIYLLGDSFGACLALSVAAANPAPDIVLILVNPATSFDRSQLQPLLPFLEIIPEKLLPCFLAATCGDPIKMASVSNAAKTWIPPAKHLQRLLHDLSSLAAGIFSLTDILPKQTLQWKLKLLKAGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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