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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001331`

染色体: Chr03 坐标: 15547480-15549833 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001331`
名称	SmilChr03G001331
描述	protein trichome birefringence-like 23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15547480 - 15549833 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017826`
GeneID	`131017826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017826`
原始查询	`SmilChr03G001331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 23
产物	protein trichome birefringence-like 23
Arabidopsis	`AT4G11090` (TBL23) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826710] identity=44.8; qcov=1.05; evalue=2.76e-130; confidence=medium
Rice	`Os06g0524400` (OsTBL49) - identity=47.6; qcov=0.881; evalue=5.49e-116; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057802547.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802547.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802547.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802547.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15547666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B106,B110,C53,C82
`Chr3:15547699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D11
`Chr3:15547931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C3
`Chr3:15547969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B126
`Chr3:15547999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B105,B13,C3
`Chr3:15548003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B103,B128,C31,C49,C55,C57
`Chr3:15548054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B12,B137,B55,C48
`Chr3:15548055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B12,B137,B55,C48
`Chr3:15548057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B35,B63,B75,C42
`Chr3:15548946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B119,B23,B64,B83,B93,C45,C53,C80
`Chr3:15548977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:15549086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,A9,B106,B110,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802547.1

396 aa

198

396

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 53-105 aa PF13839 PC-Esterase 105-392 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802547.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	53	105	2.9e-18	66.6	PMR5 N terminal Domain
`XP_057802547.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	105	392	3.4e-83	280.6	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946564.1
GTGTAATAATATGTGGCTCAATTGCATGATTAATCACATGGTACAAGTAGAACACATCAAACATGCCCTGTATAGGCTGTACCCATTTGTCTCTTTGTGAAAGTTAAAAACTATCTTAAAAGGGCTATTACATACTATGTTATTTCCAACCTATAATTCTCAAAAATGGTGTGCATTTACACTTCTGTTGCAAAGTTTGGTGCCTCAGTTATTGTATTTGTAGTTGCATTTATGCTTCTTCACCACAGATCCTCTGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017826
ATGGTGTGCATTTACACTTCTGTTGCAAAGTTTGGTGCCTCAGTTATTGTATTTGTAGTTGCATTTATGCTTCTTCACCACAGATCCTCTGATTTTCACCCACTTTCAGAAATCACCTCTGTTGGCAATGGCATCCAAGAAAATGCACGAGAAATATGTGATGTTTTTGTGGGAGATTGGGTGGGTTTTGAGGGAGAGCCTCTTTACAACAAGAGCTGCAGCTTCATCAGCAGAGGCAATCAGCTGAATTGTTTGGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802547.1
MVCIYTSVAKFGASVIVFVVAFMLLHHRSSDFHPLSEITSVGNGIQENAREICDVFVGDWVGFEGEPLYNKSCSFISRGNQLNCLENGRPDPHYLHWRWKPRACDPLKFLEMMRNKSWAFIGDSISRNHIQSLLCMLSTVEEATLVHHDKGHKSQKWIFPSYNLTASIIWSPFLAKAIIPQNIYDASPSEVDVHLDTLDPSWTQHFKTWDYMIFSSGKWYSRSSIYYDNDTVLGCHSCPKRNLTDIGFDSAYRRVIKGVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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