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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001334`

染色体: Chr03 坐标: 15576933-15579275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001334`
名称	SmilChr03G001334
描述	high mobility group B protein 13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	15576933 - 15579275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017828`
GeneID	`131017828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017828`
原始查询	`SmilChr03G001334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high mobility group B protein 13-like
产物	high mobility group B protein 13-like
Arabidopsis	`AT4G11080` (3xHMG-box1) HMG (high mobility group) box protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826709] identity=60.7; qcov=0.968; evalue=6.25e-176; confidence=high
Rice	`Os02g0258200` - identity=58.6; qcov=0.494; evalue=1.91e-74; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00505 (HMG_box); PF09011 (HMG_box_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057802549.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802549.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057802549.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057802549.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057802549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:15577482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C48,C62
`Chr3:15578052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:15578690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr3:15579060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B68,D2
`Chr3:15579143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802549.1

494 aa

247

494

HMG_box

HMG_box_2

HMG_box

HMG_box_2

HMG_box

PF00505 HMG_box 169-231 aa PF09011 HMG_box_2 170-231 aa PF09011 HMG_box_2 283-351 aa PF00505 HMG_box 286-352 aa PF09011 HMG_box_2 410-481 aa PF00505 HMG_box 413-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	169	231	2.9e-46	156.5	HMG (high mobility group) box
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	170	231	4.8e-32	111.2	HMG-box domain
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	283	351	4.8e-32	111.2	HMG-box domain
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	286	352	2.9e-46	156.5	HMG (high mobility group) box
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF09011`	HMG_box_2	Domain	410	481	4.8e-32	111.2	HMG-box domain
`XP_057802549.1`	Pfam	`PF00505`	HMG_box	Domain	413	481	2.9e-46	156.5	HMG (high mobility group) box

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946566.1
TTCACAACTTCTCTCACAACTATTCACCATTCTCTCTCTATCACTCTCTCTCCAACTTTTCCAATGGCTGCCGTAGCAGAAAACCCTACAATCGCCGACCCAGCGCCCGCGAAGAGAGGGAGAACAAAAAAAGCGCTGAAGCCGAAAACTGTCACGTCAAGTGAGGTCAACATCGCCGCCGGGGAGATTCCGGAGCCATCTCCTGTCGCCGCTCCGCCGCCGGAAAACTCCGCCGGAAAAGAGAACCACGAGAGCCTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017828
ATGGCTGCCGTAGCAGAAAACCCTACAATCGCCGACCCAGCGCCCGCGAAGAGAGGGAGAACAAAAAAAGCGCTGAAGCCGAAAACTGTCACGTCAAGTGAGGTCAACATCGCCGCCGGGGAGATTCCGGAGCCATCTCCTGTCGCCGCTCCGCCGCCGGAAAACTCCGCCGGAAAAGAGAACCACGAGAGCCTGTCTCGGAAAAAAACGAAGAAAGGGGCGGCGAAGGGGAAGCAACCGGCGTCCGACGCGTCTTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802549.1
MAAVAENPTIADPAPAKRGRTKKALKPKTVTSSEVNIAAGEIPEPSPVAAPPPENSAGKENHESLSRKKTKKGAAKGKQPASDASSFEKQLQEMQEQLEKLKIEKEQTEEMLKAKEEQLETRDREQEKLKIELKKLQKIKEFKPTVTFPLGLGIKDLEQEKKEKKKGGTKKPSPPYVLWCKDQWNEVKKSNPDTDFKEMANLLGAKWKSITVEEKKPYEERYQAEKEAYLKIAGNEKRELEAMKLLEDEQKQKTAIELLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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