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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001368`

染色体: Chr03 坐标: 16031858-16032613 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001368`
名称	SmilChr03G001368
描述	homoserine kinase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16031858 - 16032613 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018452`
GeneID	`131018452`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018452`
原始查询	`SmilChr03G001368`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homoserine kinase-like
产物	homoserine kinase-like
Arabidopsis	`AT2G17265` (HSK) homoserine kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816232] identity=73.2; qcov=0.672; evalue=5.37e-58; confidence=high
Rice	`Os02g0831800` - identity=65.2; qcov=0.608; evalue=8.67e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018452

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803155.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803155.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803155.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057803155.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057803155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16031889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B27,C15,D1
`Chr3:16031897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C13
`Chr3:16031899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B15,B27,C15
`Chr3:16031899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B27,C15
`Chr3:16031926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B112,D1,D4
`Chr3:16031929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:16031933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:16031936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B136,B60
`Chr3:16031940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B54,D11,D3
`Chr3:16031945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B21,B59,D11
`Chr3:16031952`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A4,A9,B134,B138,B46,B47,B5,B55,B66,B7,B8,B93,C22,C31,C34,C39,C44,C53,C59,C79,D7
`Chr3:16031953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947172.1
ATGGGAATGCAGAAATCGCCAGCTCAAACGAAGACCCAGCCTGACGCCTCCACGCCGAGCTCCAGCAAGCACCAGCCGCAGGGCCAGAAAAGCTCTAGTGCCGGCTTCTCCTGCTCTTTCGGCGTCTGTTTTCCACGCTCCTCCGCGCAGGTCTCAGGCTACCACGCCGACAACGTGGCACCCTCGATTTTGGGCGGATTCGTCTTGATCCGCAGCTACGAGCCCTTGGAGCTGATGCAGCTGAAATTCCCCCAAGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018452
ATGGGAATGCAGAAATCGCCAGCTCAAACGAAGACCCAGCCTGACGCCTCCACGCCGAGCTCCAGCAAGCACCAGCCGCAGGGCCAGAAAAGCTCTAGTGCCGGCTTCTCCTGCTCTTTCGGCGTCTGTTTTCCACGCTCCTCCGCGCAGGTCTCAGGCTACCACGCCGACAACGTGGCACCCTCGATTTTGGGCGGATTCGTCTTGATCCGCAGCTACGAGCCCTTGGAGCTGATGCAGCTGAAATTCCCCCAAGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803155.1
MGMQKSPAQTKTQPDASTPSSSKHQPQGQKSSSAGFSCSFGVCFPRSSAQVSGYHADNVAPSILGGFVLIRSYEPLELMQLKFPQEKSLYFVLVNPEFEAPTKKMRAALPPEVSISNHVWNCSQAGALVASVLQGDLIGLGKALSSDKIVEPRRAPLIPGMDAVKKAAIESGGARSQATTPKIEGATTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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