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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001374`

染色体: Chr03 坐标: 16196523-16199229 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001374`
名称	SmilChr03G001374
描述	uncharacterized SmilChr03G001374
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16196523 - 16199229 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018454`
GeneID	`131018454`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018454`
原始查询	`SmilChr03G001374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.3; qcov=0.954; evalue=1.69e-59; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.4; qcov=0.666; evalue=5.64e-54; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018454

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803157.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803157.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803157.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803157.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803157.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16196645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,D11
`Chr3:16196701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C73
`Chr3:16196755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C52
`Chr3:16196832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C74
`Chr3:16196859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B55,B76,C48
`Chr3:16196860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A20,B65,B79
`Chr3:16196903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr3:16196958`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C5
`Chr3:16196958`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C5
`Chr3:16197040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B10,B132,C22
`Chr3:16197040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B132,C22
`Chr3:16197174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803157.1

851 aa

426

851

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 427-526 aa PF10551 MULE 428-522 aa PF04434 SWIM 671-701 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803157.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	427	526	1e-10	41.8	Transposase, Mutator family
`XP_057803157.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	428	522	9.8e-21	74.7	MULE transposase domain
`XP_057803157.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	671	701	4.1e-07	30.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947174.1
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAATGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAAAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018454
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAATGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACGATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAAAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803157.1
MSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSNEDLCHAKLMQEVHDQLNEDGRSTYMLFYTSTTDEGRKIKVALKTDSDLNRLISEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPVPQTQERVYYEGHRSTMFPIETDIGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDQPDVEPRVGVQQLEARDWGILVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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