当前解析结果
SmilChr03G001379| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001379 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001379 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16315105 - 16317328 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018456 |
|---|---|
| GeneID | 131018456 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018456 |
| 原始查询 | SmilChr03G001379 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018456 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803159.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057803159.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057803159.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803159.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803159.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16315430 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B9 |
Chr3:16315821 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr3:16315860 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B133,B29,B4,B86 |
Chr3:16315861 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B133,B29,B4 |
Chr3:16315908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B71,C56 |
Chr3:16315909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr3:16315910 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B71 |
Chr3:16315951 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B91,C17,D8 |
Chr3:16315968 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C1 |
Chr3:16315982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:16316027 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C18,C43,D9 |
Chr3:16316080 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。