当前解析结果
SmilChr03G001388| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001388 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001388 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001388 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16427646 - 16428575 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018459 |
|---|---|
| GeneID | 131018459 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018459 |
| 原始查询 | SmilChr03G001388 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018459 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803162.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057803162.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057803162.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057803162.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803162.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16427662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr3:16427676 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B121,B17,B90,B92,D2 |
Chr3:16427676 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B17,B90,B92,D2 |
Chr3:16427690 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,C67 |
Chr3:16427706 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,C2,C76,D1 |
Chr3:16427712 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B60,C12,C21 |
Chr3:16427730 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,C86 |
Chr3:16427738 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr3:16427739 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 49 | A22,A5,B10,B110,B114,B120,B121,B122,B125,B130,B132,B135,B17,B20,B23,B33,B36,B74,B76,B86,B90,B92,B93,B94,C1,C12,C16,C18,C19,C23,C27,C33,C34,C4,C44,C45,C46,C51,C56,C66,C67,C70,C75,C76,C8,C82,D2,D3,D6 |
Chr3:16427754 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B136,B74,C57,C58 |
Chr3:16427755 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C19,C67 |
Chr3:16427761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C44,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。