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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001390`

染色体: Chr03 坐标: 16494273-16496140 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001390`
名称	SmilChr03G001390
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16494273 - 16496140 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018460`
GeneID	`131018460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018460`
原始查询	`SmilChr03G001390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=27.6; qcov=1.03; evalue=3.91e-31; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=39.4; qcov=0.359; evalue=2.58e-29; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057803163.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803163.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803163.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803163.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16494305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B98,C69
`Chr3:16494357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:16494360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:16494385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:16494387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr3:16494417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,C82
`Chr3:16494451`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C69
`Chr3:16494451`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C69
`Chr3:16494536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B78,C87
`Chr3:16494711`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	53	A19,A25,A4,A5,B100,B113,B115,B119,B122,B124,B127,B128,B130,B139,B14,B19,B29,B31,B46,B5,B52,B55,B56,B57,B62,B63,B7,B71,B75,B76,B79,B8,B82,B83,B90,B92,B98,C11,C29,C34,C37,C40,C43,C44,C59,C62,C63,C69,C77,C79,C8,C9,D4
`Chr3:16494801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:16495216`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B103,B128,B81,B97,C31,C49,C55,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803163.1

502 aa

251

502

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 133-180 aa PF23598 LRR_14 203-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803163.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	133	180	2.6e-13	50.5	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057803163.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	203	467	8e-16	58.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947180.1
ATGAAAAACCTATTTCCTGATGACTACTATAACGGAAGTAGGATTATTCTAACCACAAGCCTACAAGATGTGGCTGCATATGCTGATCCTTCTAATTCCTTTCATATGATGCGTCCCTTGAGTCAAGAAGCTAGTTGGGAATTGCTTCAAAAAAGGTTGTTTGGTTATTATGGATGGTGCAAATTGGAAAGTGTTGGAAGAGAAATTGCAGCACAATGTAGAGGATTGCCTTTTTACATTGTAGTAGTGGCAGGACTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018460
ATGAAAAACCTATTTCCTGATGACTACTATAACGGAAGTAGGATTATTCTAACCACAAGCCTACAAGATGTGGCTGCATATGCTGATCCTTCTAATTCCTTTCATATGATGCGTCCCTTGAGTCAAGAAGCTAGTTGGGAATTGCTTCAAAAAAGGTTGTTTGGTTATTATGGATGGTGCAAATTGGAAAGTGTTGGAAGAGAAATTGCAGCACAATGTAGAGGATTGCCTTTTTACATTGTAGTAGTGGCAGGACTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803163.1
MKNLFPDDYYNGSRIILTTSLQDVAAYADPSNSFHMMRPLSQEASWELLQKRLFGYYGWCKLESVGREIAAQCRGLPFYIVVVAGLLSKIDQTVDAWRQIAEENDGQLENIISLNYIHLPRHLKSCFLYMGGFPEDHQIRVSELIKLWAAEGFLHPNGSKSLEDEAEDCLEDLVDRDLKDSMHSSCTHSIICIPQKGYRPKGSLLNFSLLKVLHVLRRNDYWEWEPSQVFDLIHLTYLAANIPSSIVPPTISKLHNLQTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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