当前解析结果
SmilChr03G001394| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001394 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001394 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001394 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16539573 - 16545270 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131017855 |
|---|---|
| GeneID | 131017855 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017855 |
| 原始查询 | SmilChr03G001394 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017855 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802582.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057802582.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802582.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802582.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802582.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16539916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B1,B126,B41,B68 |
Chr3:16539916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B126,B41,B68 |
Chr3:16539953 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr3:16539953 |
T |
TG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:16540026 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A5,B17,B34,C1 |
Chr3:16540143 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C13 |
Chr3:16540153 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B71,C13,C56 |
Chr3:16540179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,C34,C58,C77 |
Chr3:16540186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C34,C58,C77 |
Chr3:16540379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr3:16540470 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A4,B71,C13,C56 |
Chr3:16540477 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | C64,C66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。