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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001400`

染色体: Chr03 坐标: 16606697-16609108 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001400`
名称	SmilChr03G001400
描述	uncharacterized SmilChr03G001400
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16606697 - 16609108 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018464`
GeneID	`131018464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018464`
原始查询	`SmilChr03G001400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=48.1; qcov=0.101; evalue=6.49e-16; confidence=weak
Rice	`Os04g0191000` - identity=37.3; qcov=0.953; evalue=3.78e-159; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF03732 (PEG10_N-capsid); PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF19259 (Ty3_capsid); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1); PF30901 (PEG10-RTL1_C-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803166.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803166.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803166.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057803166.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057803166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803166.1

803 aa

402

803

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

PEG10-RTL1_C-capsid

Asp_protease_2

gag-asp_proteas

RVP_2

PRO_PEG10-RTL1

RVT_1

PF03732 PEG10_N-capsid 89-163 aa PF19259 Ty3_capsid 113-261 aa PF30901 PEG10-RTL1_C-capsid 172-242 aa PF13650 Asp_protease_2 355-442 aa PF13975 gag-asp_proteas 356-445 aa PF08284 RVP_2 359-445 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 365-458 aa PF00078 RVT_1 597-755 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	89	163	8.8e-12	45.9	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	113	261	3.6e-13	50.1	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF30901`	PEG10-RTL1_C-capsid	Domain	172	242	9e-07	29.5	PEG10/RTL1, C-terminal capsid-like domain
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	355	442	7.5e-08	33.7	Aspartyl protease
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	356	445	1.3e-09	39.2	gag-polyprotein putative aspartyl protease
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	359	445	1.1e-06	29.2	Retroviral aspartyl protease
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	365	458	1e-09	39.5	PEG10/RTL1 protease domain
`XP_057803166.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	597	755	1.3e-40	140.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947183.1
ATGGCGACGAACAAAGAACGATTGGAGGGCTTAGAATCTTCAATGATTGAGATGAAAAACTCCATCCAACAATTGGTGGAGATCGTGACGTCTCGAGCAAGCCAACCAAAAAAACAGAGGAAGAAACACAACAGTCATGAATCAGCATCATCAGGTTCCAACTCTAGTGAGGAATCAGCGGACGACCAAAGCTCAGAGTCTGAGGGGTCCGTGAGAAGTTCAGCATCGACACAAAGGCAAGAAAAAGGGCGAAACATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018464
ATGGCGACGAACAAAGAACGATTGGAGGGCTTAGAATCTTCAATGATTGAGATGAAAAACTCCATCCAACAATTGGTGGAGATCGTGACGTCTCGAGCAAGCCAACCAAAAAAACAGAGGAAGAAACACAACAGTCATGAATCAGCATCATCAGGTTCCAACTCTAGTGAGGAATCAGCGGACGACCAAAGCTCAGAGTCTGAGGGGTCCGTGAGAAGTTCAGCATCGACACAAAGGCAAGAAAAAGGGCGAAACATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803166.1
MATNKERLEGLESSMIEMKNSIQQLVEIVTSRASQPKKQRKKHNSHESASSGSNSSEESADDQSSESEGSVRSSASTQRQEKGRNIPIRMEFPRFTGTDPHVWIDRAEQYFEVQRIEKSEKVRVASFYLEGEANQWWRWFKHVNHHRKVSWRSFKKGLLVRFESSVYEDPNEAIGKLKQTGAFRNYLSEFERLMNALPHWHPSALLGIFMAGLKEELACEVRMWKPRNLQAAIELAKRKEEQLIHSRKSVIQSMKPSPKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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