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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001401`

染色体: Chr03 坐标: 16611364-16612225 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001401`
名称	SmilChr03G001401
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16611364 - 16612225 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018465`
GeneID	`131018465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018465`
原始查询	`SmilChr03G001401`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35; qcov=0.973; evalue=5.91e-34; confidence=medium
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=37.5; qcov=0.885; evalue=2.02e-34; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803168.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803168.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803168.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803168.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803168.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16611403`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B13,B55,B97,C76
`Chr3:16611403`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B13,B55,B97,C76
`Chr3:16611487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B99,C66,C83,D8
`Chr3:16611495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:16611627`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr3:16611627`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr3:16611783`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B53,B65,B69,C38,C50,C68,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803168.1

226 aa

113

226

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 45-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803168.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	45	212	1.5e-46	158.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947185.1
ACAAAATTGCCACAAACTGTGTTTTCATATATAGATATAGATTGGCAAATAAGAAAGATAAGAGAAGAAACAGATTCAATCACAAGGGAGGTGATGATCATCAAGAATAACAGTGCAGATGCAGTGCAACTTGGTGCTTCCTCTTCCACTGCAGCAGCTTCACTATCCAGGCCTGCTCCCATCATAAAGATTGACAATATGGTTGGTTTACATGAAGATCTGCTAGCAATAAAATCTCGACTCTGTGGAGAATCGCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018465
ATGATCATCAAGAATAACAGTGCAGATGCAGTGCAACTTGGTGCTTCCTCTTCCACTGCAGCAGCTTCACTATCCAGGCCTGCTCCCATCATAAAGATTGACAATATGGTTGGTTTACATGAAGATCTGCTAGCAATAAAATCTCGACTCTGTGGAGAATCGCCCAATTTACAAGTTATCCCAATCGTTGGAATGGGGGGCATAGGAAAAACTACTCTTGCAAAGTGTGTTTACGACGACCCACTAACAGTGCAGCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803168.1
MIIKNNSADAVQLGASSSTAAASLSRPAPIIKIDNMVGLHEDLLAIKSRLCGESPNLQVIPIVGMGGIGKTTLAKCVYDDPLTVQQFDIRAWVTVSQDYNTDVVFSALLASMEEFDKDRSEESNQLAGEKVFKILKGRRYLLVMDDIWSTVAWDDVRIILPEDGNGSRVMLTTRETDVAAYADRLSGPHKMRFMDEAQSWNLLQQKVFAHQDCPPELEDVGKEIAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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