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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001404`

染色体: Chr03 坐标: 16621352-16623635 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001404`
名称	SmilChr03G001404
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16621352 - 16623635 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018466`
GeneID	`131018466`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018466`
原始查询	`SmilChr03G001404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
产物	LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR
Arabidopsis	`AT5G20480` (EFR) EF-TU receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832170] identity=42.3; qcov=0.562; evalue=1.5e-20; confidence=low
Rice	`Os06g0581500` - identity=48; qcov=0.551; evalue=3.25e-25; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018466

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057803169.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057803169.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057803169.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057803169.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16621372`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C28
`Chr3:16621372`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C28
`Chr3:16621397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B111
`Chr3:16621397`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B111
`Chr3:16621526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:16623387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B3,C14,C28,C87
`Chr3:16623407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B133
`Chr3:16623431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:16623434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:16623487`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A1,A14,A24,B109,B129,B132,B2,B46,B49,B50,B87,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803169.1

185 aa

185

LRRNT_2

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 70-88 aa PF13855 LRR_8 115-154 aa PF00560 LRR_1 120-141 aa PF00560 LRR_1 143-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803169.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	70	88	0.00024	22.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057803169.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	115	154	1.6e-06	28.5	Leucine rich repeat
`XP_057803169.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	120	141	4.3e-11	41.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057803169.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	143	165	4.3e-11	41.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947186.1
ATGGAAATTGCAATACGGAGCTCGAACTCGAGAGTCGAGACCTTTCGCTCTCTTCTATCCCTCTCTAAAATTTTCTACTACGAGAAACAGAGAGAATGGGCGCCTTTGCCGTCCACGAGCCTCCGTCGCTGCTGTCTGCGAGCTGCAGCTGGTTGCTGCTGCCGAGAGAGGCTGCTGCAGCTCGGATTCTGGGCAGCCGCTTTTGAGAATCTGAGGAACTGGTCTGAGGCAACCTCTTTCTGCATTTGGACCGGCATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018466
ATGGAAATTGCAATACGGAGCTCGAACTCGAGAGTCGAGACCTTTCGCTCTCTTCTATCCCTCTCTAAAATTTTCTACTACGAGAAACAGAGAGAATGGGCGCCTTTGCCGTCCACGAGCCTCCGTCGCTGCTGTCTGCGAGCTGCAGCTGGTTGCTGCTGCCGAGAGAGGCTGCTGCAGCTCGGATTCTGGGCAGCCGCTTTTGAGAATCTGAGGAACTGGTCTGAGGCAACCTCTTTCTGCATTTGGACCGGCATCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803169.1
MEIAIRSSNSRVETFRSLLSLSKIFYYEKQREWAPLPSTSLRRCCLRAAAGCCCRERLLQLGFWAAAFENLRNWSEATSFCIWTGITCGKKHTDRVAAINLSNMGLEGNIAKEIGNLSFLRYIDISNNSINGLIPGEIGNLRRLRVLRMAFNQLSGGIPPSLGSLRKLQGVNQTFDLGGSKKFLT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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