当前解析结果
SmilChr03G001406| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001406 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001406 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001406 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16663000 - 16664166 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018469 |
|---|---|
| GeneID | 131018469 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018469 |
| 原始查询 | SmilChr03G001406 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018469 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803170.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057803170.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803170.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803170.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803170.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16663047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,B79 |
Chr3:16663048 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr3:16663051 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B65 |
Chr3:16663081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C68 |
Chr3:16663081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr3:16663092 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A14,A20,A24,A9,B104,B117,B122,B18,B24,B26,B34,B55,B82,B88,C1,C12,C17,C19,C2,C32,C36,C41,C50,C60,C61,C68,C75,C78,D11,D7 |
Chr3:16663100 |
TGA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A14,A20,A9,B104,B117,B122,B18,B24,B26,B34,B55,B82,B88,C1,C12,C17,C19,C2,C32,C36,C41,C50,C60,C61,C68,C75,C78,D11,D7 |
Chr3:16663135 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,B77 |
Chr3:16663144 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr3:16663152 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B84,C33 |
Chr3:16663172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B102,B35,B77,C71 |
Chr3:16663324 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B108,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。