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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001417`

染色体: Chr03 坐标: 16810959-16813209 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001417`
名称	SmilChr03G001417
描述	protein trichome birefringence-like 23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	16810959 - 16813209 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017890`
GeneID	`131017890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017890`
原始查询	`SmilChr03G001417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 23
产物	protein trichome birefringence-like 23
Arabidopsis	`AT4G11090` (TBL23) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826710] identity=45.3; qcov=1.03; evalue=4.96e-134; confidence=high
Rice	`Os06g0524400` (OsTBL49) - identity=49; qcov=0.87; evalue=1.44e-121; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017890

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057802610.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802610.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802610.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802610.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:16811125`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	B115,B139,B19,B22,B40,B46,B5,B57,B71,B82,C38,C48,C59,C71,D4,D9
`Chr3:16811167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:16811171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:16811194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B13,C3
`Chr3:16811222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B8
`Chr3:16811245`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr3:16811245`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr3:16811250`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B108
`Chr3:16811250`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B108
`Chr3:16811259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:16811265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:16811281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802610.1

401 aa

200

401

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 53-105 aa PF13839 PC-Esterase 106-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802610.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	53	105	5.5e-18	65.8	PMR5 N terminal Domain
`XP_057802610.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	106	397	2.4e-86	291.0	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946627.1
ATTTCCAACCTATAATTCTCAAAAATGGTGTGCATTTACACTTCTGTTGCAAAGTTTGGTGCCTCAGTTATTGTATTTGTAGTTGCATTTATGCTTCTTCACCACAAATCCTCTGATTTTCACCCACTTTCAGAAATCACCTCTGTTGGCAATGGCATCCAAGAAAATGCACGAGAAATATGTGATGTTTTTGTGGGAGATTGGGTGGGTTTTGAGGGAGAGCCTCTTTACAACAAGAGCTGCAGTTTCATCACCAGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017890
ATGGTGTGCATTTACACTTCTGTTGCAAAGTTTGGTGCCTCAGTTATTGTATTTGTAGTTGCATTTATGCTTCTTCACCACAAATCCTCTGATTTTCACCCACTTTCAGAAATCACCTCTGTTGGCAATGGCATCCAAGAAAATGCACGAGAAATATGTGATGTTTTTGTGGGAGATTGGGTGGGTTTTGAGGGAGAGCCTCTTTACAACAAGAGCTGCAGTTTCATCACCAGAGGCAATCAGCTGAATTGTTTGGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802610.1
MVCIYTSVAKFGASVIVFVVAFMLLHHKSSDFHPLSEITSVGNGIQENAREICDVFVGDWVGFEGEPLYNKSCSFITRGNQLNCLENGRPDPHYLHWRWKPRACELPRFDPLKFLEMMRNKSWAFIGDSISRNHIQSLLCMLSTVEEATLVHHDKGHKSQKWIFPSYNLTASIIWSPFLAKAIIPQNIYDASPSEVDVHLDTLDPSWTQHFKTWDYMIFSSGKWYSRSSIYYDNDTVLGCHSCPKRNLTDIGFDSANRRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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