当前解析结果
SmilChr03G001423| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001423 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001423 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001423 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 16857776 - 16858627 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131017896 |
|---|---|
| GeneID | 131017896 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131017896 |
| 原始查询 | SmilChr03G001423 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131017896 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802616.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057802616.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057802616.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802616.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802616.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:16858147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr3:16858394 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B41,C10,C74 |
Chr3:16858397 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr3:16858452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B41,C10,C74 |
Chr3:16858510 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 62 | A11,A15,A21,B102,B108,B112,B119,B12,B121,B124,B125,B127,B131,B134,B137,B14,B16,B18,B22,B23,B31,B35,B38,B39,B42,B43,B51,B53,B55,B56,B59,B61,B62,B66,B70,B75,B77,B85,B88,B94,B96,B97,B98,C11,C13,C15,C21,C23,C31,C33,C44,C48,C50,C54,C62,C63,C65,C69,C81,C85,D4,D9 |
Chr3:16858518 |
G |
GTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B108,B97,C23 |
Chr3:16858518 |
G |
GTC |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B108,B97,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。