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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001445`

染色体: Chr03 坐标: 17238748-17244183 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001445`
名称	SmilChr03G001445
描述	endoglucanase 6-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17238748 - 17244183 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017914`
GeneID	`131017914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017914`
原始查询	`SmilChr03G001445`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 6-like
产物	endoglucanase 6-like
Arabidopsis	`AT1G64390` (GH9C2) glycosyl hydrolase 9C2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842747] identity=77.2; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0220100` (OsCel9A) - identity=59.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9); PF09478 (CBM49)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057802635.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057802635.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057802635.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802635.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802635.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17239317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C78
`Chr3:17239355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:17239571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B134,B14,B90,C19
`Chr3:17239612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B9,C76
`Chr3:17240118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B46,D3,D6
`Chr3:17241420`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr3:17241420`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr3:17242008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:17242013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:17242860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:17243073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:17243409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802635.1

629 aa

314

629

Glyco_hydro_9

CBM49

PF00759 Glyco_hydro_9 31-490 aa PF09478 CBM49 537-614 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802635.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	31	490	8.7e-168	559.8	Glycosyl hydrolase family 9
`XP_057802635.1`	Pfam	`PF09478`	CBM49	Domain	537	614	2.5e-27	95.7	Carbohydrate binding domain CBM49

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946652.1
ACAAAAGCACATGCCTCTGCCCATTTTCATAAATAATATACCAACAATTTTTATTGTTTTCTTCCAAATTATAATAAATAAAATGAATAGAATTAATGGTAGATACAAAAGGGGAAAATACAAGAAATTATCATTTAATAATCTATGCCCTTTCCCTGTAGTGTTGGCACCTCCTTCCCTCCTCCATATATACTGCCTTCATCTCTGCCAATTCTCCCACTCCTCTCACTCCTCATTTTCTCTCTCTTCCTCCTCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017914
ATGGAGAAATCTGTGGGGCTCTGTTTTTCAATGGCTCCCCTGTTTTTGCTGGTTGGTTTTCTGGCGCCGCTGGCATTGGCCGGCCACAACTACGGCGACGCTCTAAGCAAGAGCATTCTCTTCTTCGAGGCGCAGAGATCTGGTTACTTGCCCGGCAACCAAAGAGTGCGGTGGAGGGGTAATTCCGGCCTAAATGATGGAAAAACTAGCGGGGTGGATTTGGTTGGAGGATACTACGATGCAGGAGACAACGTGAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802635.1
MEKSVGLCFSMAPLFLLVGFLAPLALAGHNYGDALSKSILFFEAQRSGYLPGNQRVRWRGNSGLNDGKTSGVDLVGGYYDAGDNVKFGLPMAFTITMMSWSILEYGKQMAASGELGHAIDAVKWGTDYLIKAHPQPDVLYGEVGDGNTDHYCWQRPEDMTTSRAAYRIDPSRPGSDLAGETAAAMAAASMVFRRYNSAYSAELLKHAYQLFDFADKYRGKYDSSITIAQKYYRSVSGYADELLWGAAWMYKATNNAYYLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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