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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001448`

染色体: Chr03 坐标: 17272952-17277546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001448`
名称	SmilChr03G001448
描述	uncharacterized SmilChr03G001448
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17272952 - 17277546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017917`
GeneID	`131017917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017917`
原始查询	`SmilChr03G001448`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0212200; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0212200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23840` (AT4G23840) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828483] identity=47.6; qcov=0.959; evalue=2.59e-149; confidence=high
Rice	`Os05g0212200` - identity=49.2; qcov=0.954; evalue=5.77e-166; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802636.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802640.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057802636.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802640.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17273328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B105
`Chr3:17273420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:17274215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C30
`Chr3:17275252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:17275289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr3:17275963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:17275965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B60,B95,C1,C61
`Chr3:17276347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C56
`Chr3:17277084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C76
`Chr3:17277130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802636.1

583 aa

292

583

LRR_6

PF13516 LRR_6 110-130 aa

XP_057802638.1

583 aa

292

583

LRR_6

PF13516 LRR_6 110-130 aa

XP_057802639.1

583 aa

292

583

LRR_6

PF13516 LRR_6 110-130 aa

XP_057802640.1

543 aa

272

543

LRR_6

PF13516 LRR_6 70-90 aa

XP_057802641.1

543 aa

272

543

LRR_6

PF13516 LRR_6 70-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802636.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	110	130	3.7e-07	30.4	Leucine Rich repeat
`XP_057802638.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	110	130	3.7e-07	30.4	Leucine Rich repeat
`XP_057802639.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	110	130	3.7e-07	30.4	Leucine Rich repeat
`XP_057802640.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	70	90	9.3e-08	32.3	Leucine Rich repeat
`XP_057802641.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	70	90	9.3e-08	32.3	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946655.1
ACTGATAAAAATCTAAAACAGCAATTTTGTTTTTAATCAAAACCGAGTTAATTGAATCCGAGAATTCATTAGAATACAAGTGCTAGGAAATCATTAAGGAGACCGCAGACTATTCAAAGTCAATTCTTCCTCATCAATCCGCAATAGTTATATACATTTATCAATTGTCGGCCAATTTCCTCAAAATATTCTTAAAATTAAGAAGGCGCAGCTGAAACTGAGGAACTAAAACAATGGAGAGTTTGTTGGTGCGCATGTGC...

XM_057946653.1
ATTGTCCTTTTTATATGTTTTTCCTCATTTGTTTCCTCGATCTCATTTGTGCTTCTTTTTTAATCTTCAGTATTCAAAGTCAATTCTTCCTCATCAATCCGCAATAGTTATATACATTTATCAATTGTCGGCCAATTTCCTCAAAATATTCTTAAAATTAAGAAGGCGCAGCTGAAACTGAGGAACTAAAACAATGGAGAGTTTGTTGGTGCGCATGTGCATCGAGGCGGCGACTGAGAGCGCCGTCGCCGTGGATAAGT...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131017917
ATGGAGAGTTTGTTGGTGCGCATGTGCATCGAGGCGGCGACTGAGAGCGCCGTCGCCGTGGATAAGTGGCGGAGGCAGCGGCGAACTCTTGAGCGCATGCCGTCTCATCTCGCTGAGGCTCTCCTTCGCCATCTCCTCCACCGCCGCATGCTTTATCCCTCTCTTCTCGAAGTTTTCAAATACAGTGTAGAGGCCATCGATCTAAGGGGTGAAAGCTTTGTGGATGCTGAATGGATGGCATACTTGGGTGCATTCCGCTA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057802636.1
MESLLVRMCIEAATESAVAVDKWRRQRRTLERMPSHLAEALLRHLLHRRMLYPSLLEVFKYSVEAIDLRGESFVDAEWMAYLGAFRYLNSLILADCHKINNAALWNITGMTNLKELDLSRCSKITDAGIQHLLSLPALEKLRISETGVTADGVAILASLQNLLLLDLGGLPVTDSALNSLQTLTKLQHLDLWGSEVSNDSAIVLKMFPNLSFLNLAWTNVTTLPNLPSLTCLNMSNCTIDSLSEGEDQKPRLEKVIFSGA...

XP_057802638.1
MESLLVRMCIEAATESAVAVDKWRRQRRTLERMPSHLAEALLRHLLHRRMLYPSLLEVFKYSVEAIDLRGESFVDAEWMAYLGAFRYLNSLILADCHKINNAALWNITGMTNLKELDLSRCSKITDAGIQHLLSLPALEKLRISETGVTADGVAILASLQNLLLLDLGGLPVTDSALNSLQTLTKLQHLDLWGSEVSNDSAIVLKMFPNLSFLNLAWTNVTTLPNLPSLTCLNMSNCTIDSLSEGEDQKPRLEKVIFSGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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