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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001465`

染色体: Chr03 坐标: 17524203-17528286 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001465`
名称	SmilChr03G001465
描述	uncharacterized SmilChr03G001465
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17524203 - 17528286 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017932`
GeneID	`131017932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017932`
原始查询	`SmilChr03G001465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=29.3; qcov=0.871; evalue=5.41e-59; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.1; qcov=1.01; evalue=3.11e-67; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802661.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057802661.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802661.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802661.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17526617`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A13,A2,B104,B105,B11,B112,B120,B122,B140,B16,B20,B21,B27,B29,B3,B30,B34,B35,B44,B45,B47,B50,B55,B57,B6,B62,B64,B68,B69,B73,B78,B85,B89,B93,B97,C10,C2,C27,C28,C31,C35,C45,C48,C50,C51,C53,C56,C58,C60,C62,C63,C65,C67,C75,C81,C82,C85,D1,D8
`Chr3:17526650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:17526651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:17526671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B41,C15
`Chr3:17526672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr3:17526672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:17526684`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C15
`Chr3:17526684`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C15
`Chr3:17526702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B74,B75,B77,C59,D6
`Chr3:17526744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr3:17526750`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:17526750`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802661.1

521 aa

260

521

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 134-227 aa PF00872 Transposase_mut 134-280 aa PF04434 SWIM 379-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802661.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	134	227	4.9e-21	75.6	MULE transposase domain
`XP_057802661.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	134	280	1.1e-12	48.3	Transposase, Mutator family
`XP_057802661.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	379	410	2.2e-05	24.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946678.1
GGAACATAGGAAACAAAAGAAATATCATTGTTTTGTCTTCAACATACGAAACAAAACAATTTGGAAGGAAGTTTGCTTGGAGTTCCAATATTTTGTTTGTTTAAGGAAGAAAAGAGATATAATACCAGATGACGGAGTGGAAGAATATCATTGTTAACTATGGAGGATATTGGAATGATATTCTTTATAATGGTGGGAGTGCAACATTTTGTTATGTCCGAGCAGATAATATACGTATTTCGGAATTACGGCAAAGTATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017932
ATGATTCGAAAGTTTGGTCCTGCCCATACTTGCATTGGGGAACTTGTTAACACTGGCGTGCGAAAGGTCCATGCTCATGTCATTGCAGCACATTTAGCAAAGAAAATGTGTGAAGATGGTGAAATTGTGAAGCCGAGGTCCATTATATCCGACCTACAACGAGAGCATGGTGTCAAGGTCAGCTATGGTGTTGCACTGCGGGCCCGTAATTTGGCTGTAGAGATGATATATGGCGGCCACAAAGAATCATATTCATTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802661.1
MIRKFGPAHTCIGELVNTGVRKVHAHVIAAHLAKKMCEDGEIVKPRSIISDLQREHGVKVSYGVALRARNLAVEMIYGGHKESYSLLPGYLHMLRMCNPGSLTDLDIDAEGRFKHLFVALGSCRVAYTMCLRPIIVVDGTHLKGRNKGILFVAVTKDGNEQVFPMAFGVGPIENDESWTWFLSRLRMAYGQNAETLIVSDAHISIANAVKAVYPDAAHGLCYYHLLNKITRYGKAAVALYQKAAYAYRESEFDAAMASLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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