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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001474`

染色体: Chr03 坐标: 17684069-17684854 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001474`
名称	SmilChr03G001474
描述	uncharacterized SmilChr03G001474
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	17684069 - 17684854 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018484`
GeneID	`131018484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018484`
原始查询	`SmilChr03G001474`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0930300` - identity=21.1; qcov=0.946; evalue=5.74e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803182.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057803182.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803182.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803182.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803182.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:17684102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A11,A13,A16,A18,A22,B10,B103,B108,B119,B120,B128,B140,B35,B36,B4,B53,B54,B58,B66,B81,B84,B89,B94,B97,C13,C15,C16,C24,C31,C34,C36,C4,C42,C47,C55,C57,C63,C67,C78,D5
`Chr3:17684110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr3:17684123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A1,A13,A20,A9,B101,B106,B11,B114,B121,B129,B132,B2,B25,B34,B61,B86,B88,C11,C12,C36,C37,C4,C51,C65,C69
`Chr3:17684133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A3,B124,B49,B79
`Chr3:17684137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:17684146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr3:17684148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B51,B72
`Chr3:17684151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C87
`Chr3:17684158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B100,D11
`Chr3:17684158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D11
`Chr3:17684172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:17684184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803182.1

261 aa

130

261

RVT_3

PF13456 RVT_3 120-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803182.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	120	235	1.7e-11	44.8	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947199.1
ATGGGAGTTAGGAAGACGTGGAAAGCTAGTAGATATTGGCGGATTATGTGTAAGGCGGAGGGGCTGGACTTAATGCAGATTGCTTGGGCAATACATGAGGAATTCACACGTGAAGAGTATGAAGTTTGGGCGATTATGGTTTGGCAAGTGTGGGTGTTCAAATGCCGATCCAAACAGGAGAAGACGAGGGTGAAGAACGAGGTGTCGGAGAGTGAATGTCTGATCTTATGGGAGAGCTTCCAACGAGCAAAGTCGGCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018484
ATGGGAGTTAGGAAGACGTGGAAAGCTAGTAGATATTGGCGGATTATGTGTAAGGCGGAGGGGCTGGACTTAATGCAGATTGCTTGGGCAATACATGAGGAATTCACACGTGAAGAGTATGAAGTTTGGGCGATTATGGTTTGGCAAGTGTGGGTGTTCAAATGCCGATCCAAACAGGAGAAGACGAGGGTGAAGAACGAGGTGTCGGAGAGTGAATGTCTGATCTTATGGGAGAGCTTCCAACGAGCAAAGTCGGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803182.1
MGVRKTWKASRYWRIMCKAEGLDLMQIAWAIHEEFTREEYEVWAIMVWQVWVFKCRSKQEKTRVKNEVSESECLILWESFQRAKSAYALNTVMGLEYGDKKWQQPKRDEYRVDVDILYDESTQAFGVGVIARDEHGKIIAALAKRTRPTSNTMVAEVMAVVEGIVFSIEGDLQPIRIYTNSMLAARVMADPAEEAVFLPQDIRDILDVARSSILIGVFHMYRSANTAAHSLAQFARHCEHPMRWTQDFPTWLRNIVRNDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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