当前解析结果
SmilChr03G001496| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001496 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001496 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001496 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 18253381 - 18253779 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018488 |
|---|---|
| GeneID | 131018488 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018488 |
| 原始查询 | SmilChr03G001496 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018488 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057803187.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057803187.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057803187.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057803187.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803187.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:18253404 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 41 | A1,A20,A23,A24,A5,A9,B101,B107,B11,B114,B120,B126,B139,B22,B24,B25,B4,B50,B51,B53,B58,B59,B60,B65,B69,B77,B85,C19,C23,C28,C36,C4,C45,C61,C68,C74,C78,C80,C87,D10,D2 |
Chr3:18253425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B22,B7,C28 |
Chr3:18253426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C45 |
Chr3:18253448 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr3:18253509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B41,B77,C18 |
Chr3:18253523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B65,B94,B99,C14,C86 |
Chr3:18253526 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B94,B99,C14,C86 |
Chr3:18253644 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C59 |
Chr3:18253648 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:18253654 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
Chr3:18253666 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr3:18253672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。