当前解析结果
SmilChr03G001509| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001509 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001509 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001509 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 18509090 - 18509806 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018491 |
|---|---|
| GeneID | 131018491 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018491 |
| 原始查询 | SmilChr03G001509 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018491 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803192.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803192.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803192.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803192.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803192.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:18509105 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B12,B98,C14,C42,C82 |
Chr3:18509127 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B129,B132,B2,C12 |
Chr3:18509141 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B13,C58 |
Chr3:18509141 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,C58 |
Chr3:18509151 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A19,B120,C35,D1,D4 |
Chr3:18509168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B108,B66,C36 |
Chr3:18509172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C46 |
Chr3:18509182 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr3:18509190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A23,A4,B27,B6,B71,B78,C38,C71,D9 |
Chr3:18509198 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A8,B113,B119,B132,B16,B18,B25,B6,B70,B72,C20,C22,C25,C27,C4,C47,C51,C67,C70,D5,D8 |
Chr3:18509213 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A15,C55 |
Chr3:18509213 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | A15,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。