当前解析结果
SmilChr03G001540| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001540 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001540 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001540 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 19307128 - 19308251 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018498 |
|---|---|
| GeneID | 131018498 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018498 |
| 原始查询 | SmilChr03G001540 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0004857 (enzyme inhibitor activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018498 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057803199.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057803199.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803199.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803199.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803199.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:19307184 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 58 | A1,A25,A4,A9,B101,B105,B108,B109,B110,B133,B137,B22,B23,B27,B4,B41,B44,B45,B5,B51,B53,B57,B65,B7,B77,B89,B9,B90,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C10,C17,C19,C21,C23,C26,C29,C3,C36,C4,C47,C49,C54,C55,C6,C64,C65,C66,C70,C72,C82,C83,C85,C87 |
Chr3:19307208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A10,C82 |
Chr3:19307220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C20,C7 |
Chr3:19307231 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr3:19307249 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,C68,D3 |
Chr3:19307251 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B134,B136,B137,B40,B45,C15,C60 |
Chr3:19307290 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr3:19307297 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,B127 |
Chr3:19307300 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
Chr3:19307321 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B35,B55 |
Chr3:19307322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B94,C21,C72 |
Chr3:19307537 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。