当前解析结果
SmilChr03G001559| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001559 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001559 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001559 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 19658140 - 19659509 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018019 |
|---|---|
| GeneID | 131018019 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018019 |
| 原始查询 | SmilChr03G001559 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018019 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057802746.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057802746.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057802746.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057802746.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057802746.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:19658680 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B115,B21 |
Chr3:19658680 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B115,B21 |
Chr3:19658893 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 29 | A11,A20,A7,B1,B101,B118,B13,B17,B21,B24,B40,B68,B71,B73,B77,B80,B90,B92,C26,C28,C48,C53,C58,C59,C62,C74,C75,C80,D3 |
Chr3:19658896 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 29 | A11,A20,A7,B1,B101,B118,B13,B17,B21,B24,B40,B68,B71,B73,B77,B80,B90,B92,C26,C28,C48,C53,C58,C59,C62,C74,C75,C80,D3 |
Chr3:19658934 |
A |
AGC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | D7 |
Chr3:19658934 |
A |
AGC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr3:19659177 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B89,C29 |
Chr3:19659177 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B89,C29 |
Chr3:19659180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,A8,B123,C25,C44 |
Chr3:19659182 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B89,C29 |
Chr3:19659182 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B89,C29 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。