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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001570`

染色体: Chr03 坐标: 19833549-19836442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001570`
名称	SmilChr03G001570
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	19833549 - 19836442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018026`
GeneID	`131018026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018026`
原始查询	`SmilChr03G001570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7-like
Arabidopsis	`AT3G21280` (UBP7) ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821682] identity=75.5; qcov=0.645; evalue=1.24e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0550100` - identity=73.5; qcov=0.645; evalue=1.58e-18; confidence=low
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0016579 (protein deubiquitination); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061136 (regulation of proteasomal protein catabolic process); GO:0070628 (proteasome binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802749.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802750.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802751.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057802751.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:19834286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B91
`Chr3:19834290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B33,B44,B64
`Chr3:19834300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr3:19834306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B33,B41,B44,D10
`Chr3:19834315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B14,C55,C60,D5
`Chr3:19834323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B115
`Chr3:19834333`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A6,B103,B108,B121,B27,B31,B67,B7,B82,C29,C33,C45,C48,C5,C56,C78,C9,D1,D5
`Chr3:19834338`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B126,C55,C60,D5
`Chr3:19834338`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B126,C55,C60,D5
`Chr3:19834404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:19834406`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A8,B107,B12,B127,B23,B37,B38,B39,B54,B97,C59,C84
`Chr3:19834410`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C8,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009099988.1
AATATATAATACGGTTAAGGAATCCTGCGCTCTCCTTAATCCGGGGTCCTACGTGGCATCTCTAAGAATTTACCATTCAAAATCCCTGCAATTCTAGAGCCTCTAGCTCAATTCTCTATCGCTGACGTGACAATATAATTCCACATCACTTATTTTATTTTAAAAAACACAAAATCTAACATTTCTCTACCCCAATTCTCAAAACCTAAAATCAATTCCCCTTCTTCCATCTCTCACATCCGATTCTCCCTTCCCCGCCG...

XR_009099990.1
AATATATAATACGGTTAAGGAATCCTGCGCTCTCCTTAATCCGGGGTCCTACGTGGCATCTCTAAGAATTTACCATTCAAAATCCCTGCAATTCTAGAGCCTCTAGCTCAATTCTCTATCGCTGACGTGACAATATAATTCCACATCACTTATTTTATTTTAAAAAACACAAAATCTAACATTTCTCTACCCCAATTCTCAAAACCTAAAATCAATTCCCCTTCTTCCATCTCTCACATCCGATTCTCCCTTCCCCGCCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131018026
ATGGGCGCCGCTTCTTCTCCGCCAGCCGTGATGCCTCCGTTCGCAGCACCATTCCCCCCGCCCCAATTCCTATCTATCCCCTTTCCTGCCGATCCAATTCTCTCGTCCCAATTCCTGCAGATCGGGTTCGAATCAGTTCCACCTTCCACCTTCGATCTGCCCTCCCGCCTCCCGGCTTCCCCCTACCTACAGAACCCGGCGGTGGCCAATGGCTCAAGACCACGGCGAACCTGGCGGTGGCCAATGGCTCAAGACCACGG...

LOC131018026
ATGGCTCAAGACCACGGCGAACCTGGCGGTGGCCAATGGCTCAAGACCACGGCCGGCTATGTTACTGTAAAGTGGCAGAAGGAAGTGTTCTCCAATATGGAAATAGACACTACCGAGCCCCCATATGTTTTCAAGCGCCAGCTTTATGACTTAACAGGAGTTCCACCAGAAAGACAAAAGATTGTGGTTAAATGTGGCTTACTTAAGGGCCAGAAACTAATGATGATGGGAACTGCAGATGAGATTGTAAAGGCTCCAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057802749.1
MAQDHGEPGGGQWLKTTAGYVTVKWQKEVFSNMEIDTTEPPYVFKRQLYDLTGVPPERQKIVVKCGLLKGQKLMMMGTADEIVKAPEKGPIFAEDMPEEEQVVTVVSPFVFPQLLSEIVPETKAHSLQYYTHSNLFFSVLNFGIAVRICSINSIQMMVKGRLILLR

XP_057802750.1
MGAASSPPAVMPPFAAPFPPPQFLSIPFPADPILSSQFLQIGFESVPPSTFDLPSRLPASPYLQNPAVANGSRPRRTWRWPMAQDHGRLCFGLDFWLEVSDCFTSCFSVAEISKHITNKVSEHCIKTYCKVAEGSVLQYGNRHYRAPICFQAPAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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