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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001578`

染色体: Chr03 坐标: 19947092-19951504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001578`
名称	SmilChr03G001578
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP42-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	19947092 - 19951504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018036`
GeneID	`131018036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018036`
原始查询	`SmilChr03G001578`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP42-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP42-like
Arabidopsis	`AT3G21640` (TWD1) FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821718] identity=75.7; qcov=0.855; evalue=3.9e-171; confidence=high
Rice	`Os12g0145500` (OsFKBP42a) - identity=76.9; qcov=0.85; evalue=1.11e-171; confidence=high
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00254 (FKBP_C); PF07719 (TPR_2); PF13181 (TPR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802760.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802760.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057802761.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057802760.1`
5	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057802761.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:19948648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:19951161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B5,B57
`Chr3:19951175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802760.1

365 aa

182

365

FKBP_C

TPR_8

PF00254 FKBP_C 64-158 aa PF13181 TPR_8 267-298 aa

XP_057802761.1

346 aa

173

346

FKBP_C

TPR_8

TPR_2

PF00254 FKBP_C 52-139 aa PF13181 TPR_8 248-279 aa PF07719 TPR_2 248-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802760.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	64	158	3e-15	57.0	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057802760.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	267	298	5e-06	27.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057802761.1`	Pfam	`PF00254`	FKBP_C	Domain	52	139	2.5e-14	54.0	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
`XP_057802761.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	248	279	3.9e-06	27.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057802761.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	248	280	8.9e-11	41.8	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946777.1
TTTCACCATTTTGGTTCCGGCTAGTGGTCAATAGTTTAAGCCCCAAACCGTTGATGATGGACTGGTTTCGGATCGGTTCATCGGAATGCGTTAACGGTTAACCGATAGATTTACTACTCACCCTAAAGTAAATAAAGAAATAAATTCCTCACTGGCCCTCTCTATGTGCAGAATCTTCTCGAACTCTCTCAAATTCCTTTCCAAAATTTCCAGCGAAACTCACATTTCTAGCACTGCTACCGGTGCCTCTCTCCCTTATT...

XM_057946778.1
GAGAAGATGATATAGTTGTTGAAGGCACCTCTGTTGTTAATGGAGAACCTCCCCAAGATGAAAGTGGTCCTCCTAAAGTAGATTCTGAAGTGGAAGTTCTTCATGAGAAAGTGAGGAAGCAAATTATTAAGAAGGGCCATGGCCAGAAGCCATCAAAATATTCAACATGCTTCTGTGAGTCCATTGAGAAACTTGTGTTTGGCCTATCAATTGTTTGCTGATTATAGAATAACATATTCCAAAAATTAAGGTGCTAGACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131018036
ATGGTGGAAGTGGAGGAGCACCAGAGAGCACATTCAGATCAAGATGGAGAAGATGATATAGTTGTTGAAGGCACCTCTGTTGTTAATGGAGAACCTCCCCAAGATGAAAGTGGTCCTCCTAAAGTAGATTCTGAAGTGGAAGTTCTTCATGAGAAAGTGAGGAAGCAAATTATTAAGAAGGGCCATGGCCAGAAGCCATCAAAATATTCAACATGCTTCTTGCATTACAGAGCATGGACTGAAAGCACACTACACAAGTT...

LOC131018036
ATGTACTTTCTGCTGGAGCTAATGTTACCTTCTTTCAACCTTAGCAGATGCAATGCTTTAGTAAATGTTCATTTTCAAATCTTCATTTTCAAATCTTCATCTCCTCATTTTACAATCAAACATGAAGTCTGTATAATGGAATTAGTAAGAGAACTTTGTGAATTGCATTACAGAGCATGGACTGAAAGCACACTACACAAGTTTGAAGATACATGGCATGAACAACAACCCCTTGAGCTTGTCCTTGGAAAAGAGAAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802760.1
MVEVEEHQRAHSDQDGEDDIVVEGTSVVNGEPPQDESGPPKVDSEVEVLHEKVRKQIIKKGHGQKPSKYSTCFLHYRAWTESTLHKFEDTWHEQQPLELVLGKEKTEMTGLAVGISSMKSGERALLHVGWELGYGKEGNFSFPNVAPMADIVYEVELIGFDETKEGKARGDMTVEERIGSADRRKMDGNALFKEEKLEAAMQQYEMAIAYLGDDFMFQLFGKYRDMALAVKNPCHLNMAACLIKLKRYDEAIAQCGIVLV...

XP_057802761.1
MYFLLELMLPSFNLSRCNALVNVHFQIFIFKSSSPHFTIKHEVCIMELVRELCELHYRAWTESTLHKFEDTWHEQQPLELVLGKEKTEMTGLAVGISSMKSGERALLHVGWELGYGKEGNFSFPNVAPMADIVYEVELIGFDETKEGKARGDMTVEERIGSADRRKMDGNALFKEEKLEAAMQQYEMAIAYLGDDFMFQLFGKYRDMALAVKNPCHLNMAACLIKLKRYDEAIAQCGIVLVEDENNVKALFRRGKARAEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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