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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001589`

染色体: Chr03 坐标: 20157875-20159314 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001589`
名称	SmilChr03G001589
描述	uncharacterized SmilChr03G001589
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20157875 - 20159314 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018507`
GeneID	`131018507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018507`
原始查询	`SmilChr03G001589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=39.6; qcov=1.04; evalue=9.11e-112; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803207.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803207.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803207.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803207.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20157898`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B135,B14,B19,C73,C75
`Chr3:20157898`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B135,B14,B19,C73,C75
`Chr3:20157907`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A14,A23,A25,A7,B12,B121,B125,B129,B130,B138,B15,B17,B32,B59,B63,B81,C15,C20,C29,C54,C73,C76,C78,C84,C9
`Chr3:20157967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:20157986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D3
`Chr3:20158006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B124,B61
`Chr3:20158022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr3:20158088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B14,B56,C73,C75
`Chr3:20158127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C84
`Chr3:20158132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B122,B94,C16
`Chr3:20158192`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	88	A15,A21,A8,B1,B10,B100,B101,B104,B106,B113,B117,B120,B123,B124,B127,B128,B131,B133,B134,B136,B16,B19,B24,B27,B28,B29,B3,B34,B35,B38,B39,B41,B46,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B6,B60,B62,B63,B67,B69,B70,B72,B74,B75,B78,B79,B84,B85,B89,B90,B92,B93,B94,C1,C10,C17,C18,C2,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C45,C46,C5,C50,C53,C54,C61,C62,C63,C68,C74,C81,C85,D2
`Chr3:20158196`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	88	A15,A21,A8,B10,B100,B101,B104,B106,B113,B117,B120,B123,B124,B127,B128,B131,B133,B134,B136,B16,B19,B24,B27,B28,B29,B3,B34,B35,B38,B39,B41,B46,B50,B52,B53,B55,B56,B58,B6,B60,B62,B63,B67,B69,B70,B72,B74,B75,B78,B79,B84,B85,B89,B90,B92,B93,B94,C1,C10,C17,C18,C2,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C45,C46,C5,C50,C53,C54,C61,C62,C63,C68,C7,C74,C81,C85,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803207.1

479 aa

240

479

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 3-75 aa PF02992 Transposase_21 274-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803207.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	3	75	1.5e-22	80.2	Transposase-associated domain
`XP_057803207.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	274	479	1.5e-89	299.5	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947224.1
ATGGACAAATCATGGATGTCCAAGAATAGGATGTCAGATGAGTATAAGGCCGGAGTAGAAGCATTCATGCAGTTTGCTACACAAAACTTAACTAATGAAGAATTGATATCATGTCCATGCTCGGCATGTGGAAATCTCACGAGCAAGAAGGTTGAGCTCGTAAGATTGCACTTGTTGTCTCGTGGTATGGATTTAACATACACAAAATGGATATGGCATGGGGAAAGATTTGCACCAAGTGGCTCAATGAATTATTTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018507
ATGGACAAATCATGGATGTCCAAGAATAGGATGTCAGATGAGTATAAGGCCGGAGTAGAAGCATTCATGCAGTTTGCTACACAAAACTTAACTAATGAAGAATTGATATCATGTCCATGCTCGGCATGTGGAAATCTCACGAGCAAGAAGGTTGAGCTCGTAAGATTGCACTTGTTGTCTCGTGGTATGGATTTAACATACACAAAATGGATATGGCATGGGGAAAGATTTGCACCAAGTGGCTCAATGAATTATTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803207.1
MDKSWMSKNRMSDEYKAGVEAFMQFATQNLTNEELISCPCSACGNLTSKKVELVRLHLLSRGMDLTYTKWIWHGERFAPSGSMNYLDQMRNDDHNFLSEEPIDMVHAAYEENDNPGEFIKLLDDAEKGLYPGCVKYTKLSAIVKLYNLKAKHNWSDKSFTDLLSLLGDMLPAYNVLPSSLYEAKKTLGTLGMEYEKIHACPNDCVLYRKEYVDYSNCPTCGVARWKESKNTSLKKRVPEKVLWYFPPISRFQRMFRSKHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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