当前解析结果
SmilChr03G001590| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001590 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001590 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001590 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 20164601 - 20166011 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018052 |
|---|---|
| GeneID | 131018052 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018052 |
| 原始查询 | SmilChr03G001590 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0773100; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | hit=Os01g0773100; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G04200 (AT1G04200)dyggve-melchior-clausen syndrome protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839439] identity=77.2; qcov=0.608; evalue=3.85e-46; confidence=medium |
| Rice | Os01g0773100- identity=77; qcov=0.602; evalue=3.62e-48; confidence=medium |
| GO | GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0007030 (Golgi organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09742 (Dymeclin) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018052 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057802770.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057802770.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057802770.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057802770.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057802770.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:20165641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,C10 |
Chr3:20165795 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,D7 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057802770.1PF09742
Dymeclin 2-100 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057802770.1 |
Pfam | PF09742 |
Dymeclin | Family | 2 | 100 | 5.8e-41 | 141.3 | Dyggve-Melchior-Clausen syndrome protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。