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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001600`

染色体: Chr03 坐标: 20332193-20334781 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001600`
名称	SmilChr03G001600
描述	uncharacterized SmilChr03G001600
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20332193 - 20334781 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018045`
GeneID	`131018045`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018045`
原始查询	`SmilChr03G001600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=30.5; qcov=0.279; evalue=1.36e-24; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=25.7; qcov=0.282; evalue=8.49e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018045

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802766.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057802766.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057802766.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057802766.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057802766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20332315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr3:20332327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B110,C62
`Chr3:20332327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C62
`Chr3:20332508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:20332509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B85,C35,C67,C87
`Chr3:20332514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:20332531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr3:20332537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B35,C39
`Chr3:20332558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,B9,C62
`Chr3:20332589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B121,B89,B93
`Chr3:20332623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr3:20332698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B57,B87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802766.1

634 aa

317

634

DUF4283

PF14111 DUF4283 215-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802766.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	215	276	6.4e-09	36.1	Domain of unknown function (DUF4283)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946783.1
GATGCTCTACTGTACCATGCGGAGTTGAAAACCCCAACGCCGTTAACTCCGGAGTCCGGAGCTCGGCGTTTCGCCCATCGCCGATCCGCCCGATCCGCCTCATCGCCGATCCAGCAGCGCCTCCAGTCGGAGCTCGGCGTGGCGGAGAGATCAAGCAGCAGTCGAACATTATACTGTTCATCGACGACTTTTCCTGCAGCGCCTCAAGTCCGGAGCTCGAGAAACGCCGATCCAGCAGCAGTCGTCCAGCAGCGGTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018045
ATGGCATCGCTCCAGCCTCCCCTCCCAAATTACCCCATAGTGTCTAATAACTTTGCTCCTGTCAGTCGATCATCATCGACACTACACAGTTCTACTAGGGATTTCACCACTGCTGATCAGACGACAATGAACTCTACGACAGTAATGACGGTGCTTCTCTTCCCCGAGTCTGGGATCACGATGCCTCCGAGCATCACGGTCACAGATAGTTCGGCGGAGGCTGCTAGAGTTACTGCTGATGTTTCATTCCCGGAAATCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802766.1
MASLQPPLPNYPIVSNNFAPVSRSSSTLHSSTRDFTTADQTTMNSTTVMTVLLFPESGITMPPSITVTDSSAEAARVTADVSFPEIAAVMTAHTVGVSTQADGPKGLIPPRSIGTAHSNVVSPSSATKVSPPPQPKASFADKLKARDGSPTEQVSKPRDVPAHDFTILRPELVDLKRCLVLEPSFHQRQVRRFAHAVHGRLILRKGESPRFAADLWQELQQLWKPSAGWSIHPLGKGYFTFNFTTDEDRAAAFAKTTWRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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