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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001608`

染色体: Chr03 坐标: 20465555-20471841 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001608`
名称	SmilChr03G001608
描述	endoglucanase 20-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20465555 - 20471841 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018062`
GeneID	`131018062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018062`
原始查询	`SmilChr03G001608`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 20-like
产物	endoglucanase 20-like
Arabidopsis	`AT4G23560` (GH9B15) glycosyl hydrolase 9B15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828456] identity=67.1; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0387400` (OsGH9B13) - identity=62.5; qcov=0.91; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057802774.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057802774.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802774.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802774.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20465637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B73,C86
`Chr3:20465691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:20465770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C58,C85
`Chr3:20465773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:20465775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B73,B87
`Chr3:20466365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B34,B97,C73
`Chr3:20467064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr3:20467083`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr3:20467083`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20467112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C28,C74
`Chr3:20467173`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:20467173`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802774.1

510 aa

255

510

Glyco_hydro_9

PF00759 Glyco_hydro_9 31-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802774.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	31	475	1.1e-157	526.5	Glycosyl hydrolase family 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946791.1
TCATAACGAAGCGAGACATGAGTTGGTGGATAATTACTTGGCTTCTTTTGTGTGGTGGTGCAAAATCCATCAAGAATAATCACCAATCATGCTCTTCTAACATCGATTACAAGGATGCTTTGAGCAAAGGTATCTTGTTCTTTCAAGGACAACGTTCTGGGAAATTGCCTGCAAACCAGCAAGTCAAGTGGAGGGCAGACTCTGCACTCTCCGACGGCCACGTCGAAAATGTAAATTTAACTGGAGGATATTATGATGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018062
ATGAGTTGGTGGATAATTACTTGGCTTCTTTTGTGTGGTGGTGCAAAATCCATCAAGAATAATCACCAATCATGCTCTTCTAACATCGATTACAAGGATGCTTTGAGCAAAGGTATCTTGTTCTTTCAAGGACAACGTTCTGGGAAATTGCCTGCAAACCAGCAAGTCAAGTGGAGGGCAGACTCTGCACTCTCCGACGGCCACGTCGAAAATGTAAATTTAACTGGAGGATATTATGATGCGGGCGACAATGTGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802774.1
MSWWIITWLLLCGGAKSIKNNHQSCSSNIDYKDALSKGILFFQGQRSGKLPANQQVKWRADSALSDGHVENVNLTGGYYDAGDNVKFGWPMSFSMSLLSWVVNEYGKEIDSSELKNLLTAIRWGTNFLLRAHTSSTTFYTQVGDGNKDHACWERPEDMDTPRTLYKITPTSPGTEAAAEAAAALAAASIAFRQPDPNYSHHLLRSSKSLFEFADKYRGSYQGSCPFYCSFSGYQDELLWAATWLYKASGDTTYLNYVSTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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