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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001611`

染色体: Chr03 坐标: 20517963-20519045 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001611`
名称	SmilChr03G001611
描述	acylamino-acid-releasing enzyme 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20517963 - 20519045 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018065`
GeneID	`131018065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018065`
原始查询	`SmilChr03G001611`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acylamino-acid-releasing enzyme 2-like
产物	acylamino-acid-releasing enzyme 2-like
Arabidopsis	`AT4G14570` (AARE) acylaminoacyl-peptidase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827104] identity=50; qcov=0.559; evalue=3.06e-10; confidence=low
Rice	`Os10g0415800` (OsPOP22) - identity=45.5; qcov=0.591; evalue=1.8e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF19283 (APEH_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802776.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057802776.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802776.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802776.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802776.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20518119`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	172	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B112,B114,B115,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B52,B53,B55,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B68,B69,B72,B74,B75,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B96,C1,C10,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C71,C72,C74,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D6,D7,D9
`Chr3:20518164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20518170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B52,B72,B9,C12
`Chr3:20518180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A5,B10,B107,B109,B135,B3,B37,B44,B5,B54,B62,B7,C34,C43,C77,C79
`Chr3:20518206`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A11,A20,A23,B118,B13,B17,B21,B24,B40,B75,B77,B90,B92,C28,C53,C58,C60,C74,C75,C80,D3
`Chr3:20518212`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C58,C85
`Chr3:20518212`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:20518236`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B39,C72
`Chr3:20518257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B9
`Chr3:20518344`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C77
`Chr3:20518344`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C77
`Chr3:20518358`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B91,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802776.1

93 aa

APEH_N

PF19283 APEH_N 11-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802776.1`	Pfam	`PF19283`	APEH_N	Repeat	11	84	7.5e-13	48.5	Acylamino-acid-releasing enzyme, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100008.1
ATTTGGTTTATACTCTCTCTCTCTAAGAGAAAACTGTTGTAATAAGTATAGCAGTTCAATCAGCCATGGATGAAGAAGAATATGCTTCTATGTCTAAGTTGCTACAAGAATTTACAAGCATCCCAGCCATTGATAAAGCATGGACTTTCAAATCTGAGACTGAAGATGCTTCCACTGGAATGTTCCTACTCATGTCCAGCCATCAAACAAGTCGTCAGAGAAAACGGTCCAGATCAAGGGCCACCCAATTGAGCAGAAAA...

XM_057946793.1
TATTGTTTTGTTGGATTCTTGATCTATTCACTGACTTTATGGATGAAACGACGTGTTTGTGATGGCAAAGTATCCGATGTTGCAATGCTGATGTTATTTGTTTGCAATATCTGACGACTTGTTCAAAAAAAGAGAGGCAATAATAAGAATATTCCATCTCCAAAGAAGAAGAGTAGAAAGAGCTAGAAATGAGCAACCATACAAGAAGTATAGCAGTTCAATCAGCCATGGATGAAGAAGAATATGCTTCTATGTCTAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018065
ATGAGCAACCATACAAGAAGTATAGCAGTTCAATCAGCCATGGATGAAGAAGAATATGCTTCTATGTCTAAGTTGCTACAAGAATTTACAAGCATCCCAGCCATTGATAAAGCATGGACTTTCAAATCTGAGACTGAAGATGCTTCCACTGGAATGTTCCTACTCATGTCCAGCCATCAAACAAGTCGTCAGAGAAAACGGTCCAGATCAAGGGCCACCCAATTGAGCAGAAAAGCAACTACTGTGGTTAAGTCTAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802776.1
MSNHTRSIAVQSAMDEEEYASMSKLLQEFTSIPAIDKAWTFKSETEDASTGMFLLMSSHQTSRQRKRSRSRATQLSRKATTVVKSNLCLLLED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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