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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001612`

染色体: Chr03 坐标: 20523231-20524538 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001612`
名称	SmilChr03G001612
描述	uncharacterized SmilChr03G001612
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20523231 - 20524538 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018514`
GeneID	`131018514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018514`
原始查询	`SmilChr03G001612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=62.2; qcov=0.414; evalue=1.54e-62; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=53.3; qcov=0.733; evalue=2.37e-124; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803214.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057803214.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057803214.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803214.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20523231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:20523271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20523272`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	37	A19,A23,A4,A5,A6,A7,A9,B102,B106,B122,B136,B137,B139,B15,B20,B33,B42,B47,B55,B65,B67,B77,C12,C17,C21,C24,C29,C4,C45,C51,C56,C6,C63,C78,C84,C87,D11
`Chr3:20523274`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C18,C25
`Chr3:20523274`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C18,C25
`Chr3:20523276`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A24,B20,B45,B52,B72
`Chr3:20523276`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A24,B20,B45,B52,B72
`Chr3:20523325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B40
`Chr3:20523328`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr3:20523328`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr3:20523347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B15,B55,C43
`Chr3:20523356`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A9,B113,B19,B75,C12,C5,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803214.1

435 aa

218

435

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 81-118 aa PF04827 Plant_tran 187-388 aa PF13359 DDE_Tnp_4 216-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803214.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	81	118	4.6e-18	65.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057803214.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	187	388	6.5e-103	343.4	Plant transposon protein
`XP_057803214.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	216	379	4.3e-15	56.4	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947231.1
ATGAATCATCATAATATTGGTTCTTCTTCACTACTTTCTCATTCAAGTTCAAGCTCATCTGATGATGAGCTTGAACAATTAATCAACGAGTGTGATGTTGAACATCAATTGATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATAAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018514
ATGAATCATCATAATATTGGTTCTTCTTCACTACTTTCTCATTCAAGTTCAAGCTCATCTGATGATGAGCTTGAACAATTAATCAACGAGTGTGATGTTGAACATCAATTGATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATAAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803214.1
MNHHNIGSSSLLSHSSSSSSDDELEQLINECDVEHQLMGQHILNNNLIVAQLAEYKNATKIHGGSVLGHKVIHRDREAAAHRLFNDYFSENPTFNEGMFRRLFRMSRSLFLRIVDAVKNHNGFFEQRMDCTGRWGLSTLQKITAAFRILAYGVPADATDEYINIGESTAIKCVKKFCRAIVEIFSDQYLRSPNASDVARLLYIGKQRGFPGMLGSLDCMHWKWKNCPTGWASSYAGRSGSPTIILEIVADYDLWIWHAFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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