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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001614`

染色体: Chr03 坐标: 20530883-20533147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001614`
名称	SmilChr03G001614
描述	meiotic recombination protein SPO11-2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20530883 - 20533147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018068`
GeneID	`131018068`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018068`
原始查询	`SmilChr03G001614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	meiotic recombination protein SPO11-2
产物	meiotic recombination protein SPO11-2
Arabidopsis	`AT1G63990` (SPO11-2) sporulation 11-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842702] identity=69.7; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0156900` (OsTOP6A2) meiotic recombination protein SPO11-2-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4344697] identity=61; qcov=0.987; evalue=2.17e-177; confidence=high
GO	GO:0000228 (nuclear chromosome); GO:0000706 (meiotic DNA double-strand break processing); GO:0003677 (DNA binding); GO:0003918 (DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination); GO:0042138 (meiotic DNA double-strand break formation)
KEGG	-
Pfam	PF04406 (TP6A_N); PF21180 (TOP6A-Spo11_Toprim)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057802778.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057802778.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802778.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802778.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20530965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:20531344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59
`Chr3:20531618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:20532454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B86
`Chr3:20532928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B91,C39,D6,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802778.1

382 aa

191

382

TP6A_N

TOP6A-Spo11_Toprim

PF04406 TP6A_N 95-158 aa PF21180 TOP6A-Spo11_Toprim 210-376 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802778.1`	Pfam	`PF04406`	TP6A_N	Domain	95	158	4.5e-16	59.2	Type IIB DNA topoisomerase
`XP_057802778.1`	Pfam	`PF21180`	TOP6A-Spo11_Toprim	Domain	210	376	1.4e-41	143.1	Topoisomerase 6 subunit A/Spo11, Toprim domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946795.1
TCCACTATTTTCCTCCTCCTGCGCATCGAGAAAATGGGAGACCTGCTGAAGAACTCCATATTTTTTTCAGATCAACACATTTGCTACGCCGATATCCTTCCTCCTTCTGAGGTTCGGCTTCGGATCGAAGTTGCAATCCTTAGTTTCCTGAGAAACCTCAGTTCCTCAACTCCGTCAGTATCAGATATACCTTTGATTAGCAGGAAGATGAGCAATAGCAGAGTTAGTCGAGGATTACTGACCGAAAACACGAGGATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018068
ATGGGAGACCTGCTGAAGAACTCCATATTTTTTTCAGATCAACACATTTGCTACGCCGATATCCTTCCTCCTTCTGAGGTTCGGCTTCGGATCGAAGTTGCAATCCTTAGTTTCCTGAGAAACCTCAGTTCCTCAACTCCGTCAGTATCAGATATACCTTTGATTAGCAGGAAGATGAGCAATAGCAGAGTTAGTCGAGGATTACTGACCGAAAACACGAGGATTTTTCTTTCGGATTCGTTTTCTACGAAGTCTTTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802778.1
MGDLLKNSIFFSDQHICYADILPPSEVRLRIEVAILSFLRNLSSSTPSVSDIPLISRKMSNSRVSRGLLTENTRIFLSDSFSTKSLMNENTANSLIRVWKVMEMCYQILGQEKKVTQRELFYKLLSDSPQYFTSQLQVNRSIQDLVALLRCSRYSLGIMATSRGVVAGRLILQEPNQDVIDCSVCGSSGYAISGDLNFLENLVIKSDARYIIVVEKHAVFQRLAEDRLFNQIPCILITAKGYPDIGTRFLLHRMSREFPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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