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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001615`

染色体: Chr03 坐标: 20533969-20538956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001615`
名称	SmilChr03G001615
描述	G-patch domain-containing protein 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20533969 - 20538956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018066`
GeneID	`131018066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018066`
原始查询	`SmilChr03G001615`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-patch domain-containing protein 1
产物	G-patch domain-containing protein 1
Arabidopsis	`AT1G63980` (AT1G63980) D111/G-patch domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842701] identity=49; qcov=1.11; evalue=3.86e-109; confidence=high
Rice	`Os03g0125300` - identity=47.3; qcov=1.1; evalue=5.91e-105; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0090069 (regulation of ribosome biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF01585 (G-patch); PF25879 (WHD_LYAR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802777.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057802777.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057802777.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057802777.1`
5	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057802777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20534539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C77
`Chr3:20534729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr3:20536069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B129,B132,B2,C12
`Chr3:20536851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr3:20537397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:20537575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:20538767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr3:20538771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802777.1

357 aa

178

357

G-patch

WHD_LYAR

PF01585 G-patch 16-59 aa PF25879 WHD_LYAR 285-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802777.1`	Pfam	`PF01585`	G-patch	Family	16	59	3.6e-15	56.3	G-patch domain
`XP_057802777.1`	Pfam	`PF25879`	WHD_LYAR	Domain	285	356	2.6e-20	73.3	LYAR family winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946794.1
TCTAACCGTAAATCGTGATCTCTGTATTCTAGGGTTTTAAGGTGCCTGCCGCCGCTTCACAGAACCGTCTCTTCCTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAACTCTTTGAAATCGCAGCGAGGTCAGTCAGTGGGAGGGAGAGAGTACCGGACTTGACCGTTAATATGGCGACGCCGGAAGTTCCTCTCCTCTACGTCGGAGTCTATCGGAGCTCTGCCGCCTTCCGCCTCATGAAACAAATGGGATGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018066
ATGGCGACGCCGGAAGTTCCTCTCCTCTACGTCGGAGTCTATCGGAGCTCTGCCGCCTTCCGCCTCATGAAACAAATGGGATGGGAAGAAGGCGAAGGACTTGGAAAGGAAAAGCAAGGCATCAAAGGATATGTAAGGGTAAAGAACAAACAGGATAATTTAGGTATAGGAACAGAGATACCAAATGCATGGGCTTTTGATACAACTCAATTTGACAGTATCCTCAAGAAACTGAAAGTGCAAGCGGTTGAAAAAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802777.1
MATPEVPLLYVGVYRSSAAFRLMKQMGWEEGEGLGKEKQGIKGYVRVKNKQDNLGIGTEIPNAWAFDTTQFDSILKKLKVQAVEKNKDEDSETDRNEAVEQPSPSKDKKEPVAKSTRPQGRYKRREKGKTVRSYSSQDLEGILVNKSKAPDTCNAPEVSEDEKSIESSVSDKQEKTQDLPADWWGHKLGFVFVGMLGAESRRKKSLERTMFNEDDQENLYNLAQGTKTSGKQGIGIKDRKKKIAGCYFEGKKTTFGDSDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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