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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001616`

染色体: Chr03 坐标: 20563838-20566659 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001616`
名称	SmilChr03G001616
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20563838 - 20566659 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018069`
GeneID	`131018069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018069`
原始查询	`SmilChr03G001616`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like
Arabidopsis	`AT4G11280` (ACS6) 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (acc) synthase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826730] identity=62.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0578000` (ACS2) - identity=60.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057802779.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057802779.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057802779.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802779.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802779.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20564229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20564274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:20564394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C13,C25,C5
`Chr3:20564411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:20564470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:20564505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:20564629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20564639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:20564670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:20564682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:20564702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr3:20564817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802779.1

485 aa

242

485

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 49-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802779.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	49	429	3e-103	346.5	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946796.1
CTTCATTTTGAACATTAGTATGCTACCATAATTCCTACTACTATATATATACTCCCATATTCTACTCTTAAACATATTCTCACATTTCAAATCTACTTCATATCTAATTAACATCGTTTCATTGCTTCATTCTTTTGTTCATATTGTTCCATTTCTACAGTTCCTTTTTGACATTGAACTGAAAAAGAACAAAAACAAAAACAATGGAACACTCGTTAAGGAAGCAAGAGCAGATTCTGTCCAAGATTGCAAACAACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018069
ATGGAACACTCGTTAAGGAAGCAAGAGCAGATTCTGTCCAAGATTGCAAACAACGACGGGCATGGCGAAAACTCTGCATTTTTCGACGGCTGGAAGGCGTACGACACCGATCCTTATCATCCCACCCAGAATCCTAATGGAGTTATTCAGATGGGCTTAGCAGAAAACCAACTATCCTTCGATTTAGTAGAGGAGTGGGTGCGGAACAATCCCAAGGCCTCCATTTGCACGGCAGAAGGGGCGAGCGAGTTCAAAGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802779.1
MEHSLRKQEQILSKIANNDGHGENSAFFDGWKAYDTDPYHPTQNPNGVIQMGLAENQLSFDLVEEWVRNNPKASICTAEGASEFKDIAIYQDYHGLPAFRNAVARFMEKVRGNRVRFDPDRIVMSGGATGAQETLAFCLADPGDALLVPTPYYPANDRDLTWRTGVKLVPVVCDSSNDFKMTLSGLEAAYKTAQDSNVKVKGLLLNNPSNPLGTVLDREALTMALRFTNDRNIHLICDEIYSATVFDEPGFISIAEIAQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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