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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001623`

染色体: Chr03 坐标: 20825715-20827263 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001623`
名称	SmilChr03G001623
描述	protein transport protein SFT2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20825715 - 20827263 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018072`
GeneID	`131018072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018072`
原始查询	`SmilChr03G001623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein transport protein SFT2-like
产物	protein transport protein SFT2-like
Arabidopsis	`AT4G26550` (AT4G26550) Got1/Sft2-like vescicle transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828761] identity=77.3; qcov=0.987; evalue=7.82e-33; confidence=medium
Rice	`Os06g0608600` - identity=80; qcov=0.987; evalue=9.24e-37; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	-
Pfam	PF04178 (Got1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057802781.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057802781.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057802781.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057802781.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20825995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20826007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B129,B132,B2
`Chr3:20826009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B60,B65
`Chr3:20826043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20826183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:20826214`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A11,A20,A23,A7,B118,B13,B17,B21,B24,B40,B47,B77,B78,B90,B92,C28,C33,C53,C58,C60,C61,C72,C74,C75,C77,C80,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802781.1

76 aa

Got1

PF04178 Got1 1-53 aa

XP_057802782.1

76 aa

Got1

PF04178 Got1 1-53 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802781.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	1	53	2.9e-14	54.2	Got1/Sft2-like family
`XP_057802782.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	1	53	2.9e-14	54.2	Got1/Sft2-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946798.1
TAGAGCACGACGACTTCAAGCGCTAGGGCACAGAGGAGCAAGGTAATGTAGGCGGCGCGACTTCAGGTGCGCCGGGCACGGCGGCGGCGCGATTTCAGATCTGCTGAGTCTGTGACATCGTGCTGATTGCTTCGTCGAGAAGATGAAGATGATGGAGGAGGAGTACACTAATGTAGTGGAGAATATGGCTGAAGAGGAACGATTACACTAATGTAGTGGAGAATATCGTTGAATTAGATAAGATGTCCCTGTAGGCATTT...

XM_057946799.1
AGCACGACGACTTCAAGCGCTAGGGCACAGAGGAGCAAGGTAATGTAGGCGGCGCGACTTCAGGTGCGCCGGGCACGGCGGCGGCGCGATTTCAGGTGCGCCGGGCACGATAATTCTGGTTCTATTTTTCTCCCTAATTTTGCCTTCTGTTTTTTCGCCCTGATTTTGCCTTTTGTTTTTCGGGCTTACTACGGTATATTTGTCGGGCTTCGTCGACTGTTGTTGGGCGTGGCTTCTTCTGTGCAGTCTCTCTCTGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131018072
ATGGTGTCGAAAGAGAGACTTCCTTTTACACTGGGATTTCTTGGCAGAATGGTTGGTACCATTTATGTATCCATGGTGCTCCACAGCTACCTTCTTTCCGTTTTCTTTTCTGTGTTACAGGTGCTGGCTCTCCTCTACTATGCTGTCTCCTATTTCCCCGGAGGGTCGGCCGGACTAAGATTTCTTTCTTCGACGCTCACCTCCTCCGTCCTCGGATGCTTCGGAAGTTGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057802781.1
MVSKERLPFTLGFLGRMVGTIYVSMVLHSYLLSVFFSVLQVLALLYYAVSYFPGGSAGLRFLSSTLTSSVLGCFGS

XP_057802782.1
MVSKERLPFTLGFLGRMVGTIYVSMVLHSYLLSVFFSVLQVLALLYYAVSYFPGGSAGLRFLSSTLTSSVLGCFGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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