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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001628`

染色体: Chr03 坐标: 20953186-21038761 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001628`
名称	SmilChr03G001628
描述	pectin acetylesterase 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	20953186 - 21038761 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018076`
GeneID	`131018076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018076`
原始查询	`SmilChr03G001628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 7-like
产物	pectin acetylesterase 7-like
Arabidopsis	`AT4G19410` (AT4G19410) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827682] identity=41.8; qcov=0.959; evalue=1.02e-106; confidence=medium
Rice	`Os02g0702400` - identity=41.2; qcov=0.967; evalue=2.72e-103; confidence=medium
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057802784.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057802784.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802784.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802784.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057802784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:20953653`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A19,A8,B100,B11,B139,B26,B5,B57,B69,B72,B76,B79,B99,C12,C2,C28,C38,C40,C43,C44,C71
`Chr3:20953687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:20953706`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A14,A22,A24,B46,B47,B50,B78,C27,C33,C61,C72,C77,D11,D3
`Chr3:20953838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:20954155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	55	A1,A11,A13,A16,A2,A6,B102,B104,B108,B118,B12,B123,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B14,B17,B2,B22,B23,B35,B36,B44,B55,B61,B78,B8,B83,B85,B93,B94,C12,C13,C16,C19,C23,C25,C48,C5,C50,C54,C58,C59,C61,C64,C65,C66,C8,C83,D1,D11
`Chr3:20954202`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr3:20954202`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr3:20954221`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A11,A13,A16,A2,A20,A23,A9,B102,B104,B108,B118,B12,B123,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B14,B17,B2,B21,B22,B23,B35,B36,B44,B55,B61,B77,B78,B8,B83,B85,B92,B93,B94,C13,C16,C18,C19,C23,C25,C48,C49,C5,C50,C54,C58,C59,C60,C61,C64,C65,C66,C74,C75,C8,C83,D1,D11,D3
`Chr3:20954229`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	65	A1,A11,A13,A16,A2,A20,A23,A6,A9,B102,B104,B108,B118,B12,B123,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B14,B17,B2,B21,B22,B23,B35,B36,B44,B55,B61,B77,B78,B8,B83,B85,B90,B93,B94,C13,C16,C18,C19,C23,C25,C48,C49,C5,C50,C54,C58,C59,C60,C61,C64,C65,C66,C74,C75,C8,C83,D1,D11,D3
`Chr3:21033505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr3:21033694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A9,C18,C49
`Chr3:21033694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C18,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802784.1

391 aa

196

391

PAE

PF03283 PAE 22-387 aa

XP_057802785.1

391 aa

196

391

PAE

PF03283 PAE 22-387 aa

XP_057802786.1

391 aa

196

391

PAE

PF03283 PAE 22-387 aa

XP_057802787.1

389 aa

194

389

PAE

PF03283 PAE 22-381 aa

XP_057802788.1

389 aa

194

389

PAE

PF03283 PAE 22-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802784.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	22	387	1.1e-121	407.1	Pectinacetylesterase
`XP_057802785.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	22	387	1.1e-121	407.1	Pectinacetylesterase
`XP_057802786.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	22	387	2.9e-121	405.7	Pectinacetylesterase
`XP_057802787.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	22	381	2.4e-118	396.1	Pectinacetylesterase
`XP_057802788.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	22	381	6.3e-118	394.8	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946803.1
CATCCAATAAATAACTCCCCTTTTACCCACCATACTTCACTCTTGCACAAAAATCGTATCCTTTGGTAGCTAAAATTTTCTCTCAGCTGAAACTTACTTTTCTACTTTAAGTCTTCTCTCCAGAAAAACAGCAACGCAGAAGATTCAACTCCTCAAGGTTTTGCCTCTAATTCATTCAAGATGTATATCTATGCCTAAGTTATTAATTTTGAGCTCTAACTTTGAGTTTGATTAATTATTTTAAAAAATTAATTGCCTAC...

XM_057946801.1
ATCCAATAAATAACTCCCCTTTTACCCACCATACTTCACTCTTGCACAAAAATCGTATCCTTTGGTAGCTAAAATTTTCTCTCAGCTGAAACTTACTTTTCTACTTTAAGTCTTCTCTCCAGAAAAACAGCAACGCAGAAGATTCAACTCCTCAAGGTTTTGCCTCTAATTCATTCAAGATGTATATCTATGCCTAAGTTATTAATTTTGAGCTCTAACTTTGAGTTTGATTAATTATTTTAAAAAATTAATTGCCTACG...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131018076
ATGGCAGCTCAGGGTTTTGTGTTTTGCGCTCTTCTTCTGCTAATTGCTCACCATGTCGGAGCCGATGAAGTCCCTTTCACTGAGGTCGTCAACGCCTACCAGAGGAATGCAGTTTGTTTAGACGGGTCGGCCGCTGGGTACCATCTTGCATCTGGATATGGAGATGGAGCGAAAAACTGGATAGTCTATCTAAAGGGAGGTGGATGGTGCGAAGACAACCAGGCGTGCCAACGCAACAAAACTACGTCAGTTGGGAGTAG...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057802784.1
MAAQGFVFCALLLLIAHHVGADEVPFTEVVNAYQRNAVCLDGSAAGYHLASGYGDGAKNWIVYLKGGGWCEDNQACQRNKTTSVGSSRGINFVNLTGILNQSPDVNPDFYNWNRVYVIYCDQASFLGDSSIGQGVTQLDFRGSRIYDAVIDDLLAKGMNCADNAILAGRSAGGLATILHCDEFRARLPNASRVKCISDAGFFIRAKDLPNADFRQGFYASIIKFHNISSFLPRSCTERIDSNLCLFPEYFVGDVQTPLFL...

XP_057802785.1
MAAQGFVFCALLLLIAHHVGADEVPFTEVVNAYQRNAVCLDGSAAGYHLASGYGDGAKNWIVYLKGGGWCEDNQACQRNKTTSVGSSRGINFVNLTGILNQSPDVNPDFYNWNRVYVIYCDQASFLGDSSIGQGVTQLDFRGSRIYDAVIDDLLAKGMNCADNAILAGRSAGGLATILHCDEFRARLPNASRVKCISDAGFFIRAKDLPNADFRQGFYASIIKFHNISSFLPRSCTERIDSNLCLFPEYFVGDVQTPLFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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