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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001639`

染色体: Chr03 坐标: 21149478-21151086 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001639`
名称	SmilChr03G001639
描述	protein ROH1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	21149478 - 21151086 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018089`
GeneID	`131018089`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018089`
原始查询	`SmilChr03G001639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROH1-like
产物	protein ROH1-like
Arabidopsis	`AT1G63930` (ROH1) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842696] identity=53.6; qcov=0.909; evalue=1.13e-155; confidence=high
Rice	`Os12g0164600` (OsSTA274) - identity=38.9; qcov=0.922; evalue=6.8e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05633 (ROH1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057802800.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057802800.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057802800.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057802800.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057802800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:21149725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:21149751`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A14,A15,A21,A22,A24,A3,B117,B119,B131,B24,B31,B50,B66,B85,B89,C13,C21,C27,C49,D11,D3
`Chr3:21149753`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	112	A10,A11,A13,A16,A4,A6,A9,B1,B10,B102,B104,B105,B106,B108,B111,B112,B118,B12,B120,B121,B123,B124,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B138,B140,B17,B18,B23,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B41,B42,B43,B48,B49,B52,B55,B61,B67,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B82,B83,B85,B9,B91,B93,B95,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C19,C22,C23,C25,C32,C33,C36,C38,C39,C4,C45,C46,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C61,C64,C65,C68,C69,C71,C79,C8,C82,C83,C85,D1,D11,D5,D6,D8,D9
`Chr3:21149938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B28,C18,C3,C83
`Chr3:21149994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B50,C27,D3
`Chr3:21150006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:21150087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:21150109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr3:21150138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B47,B78,C33,C72
`Chr3:21150144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B122,B73,C86
`Chr3:21150185`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr3:21150185`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057802800.1

460 aa

230

460

ROH1-like

PF05633 ROH1-like 53-448 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057802800.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	53	448	1.1e-147	492.8	Protein ROH1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057946817.1
TGATACATATACAAGGATATTAAAGAAAAAATTAGACAAAAGATAGAAAAAAACATTGCAGCTCCGAAACCAATTAAGGTCATAGCAAGGACAATATAGTAAAATTAAAAGGAAGACGTTAAAAGTAGCAAGTCGTCACACATAAATGGAGAAACGGTCAGGCTCCCGACAAAGCTTAACTATCACCCATCCCTTCCTCACTTATATCATCCAACTGCCAAAACCGTCGACGTTTAATTCATTCTTCCATAGTTTCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018089
ATGGAGAAACGGTCAGGCTCCCGACAAAGCTTAACTATCACCCATCCCTTCCTCACTTATATCATCCAACTGCCAAAACCGTCGACGTTTAATTCATTCTTCCATAGTTTCAGCATCCAAAAACAAAACAAAAAAAAATCAAAAACGAAATCAACGATGCCGGTGACTGAAAACCAAAGCTCCTTCCTCAACCGCATAAGCATCCGTCGCAATCAGATCGCATCCCTCGACAGCAGCAGTAATGAGCAGGAGCAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057802800.1
MEKRSGSRQSLTITHPFLTYIIQLPKPSTFNSFFHSFSIQKQNKKKSKTKSTMPVTENQSSFLNRISIRRNQIASLDSSSNEQEQEDFDVFIRHVADRFSALLPAAESPCAAAPQLLTISWFRDLLDAFLCCESEFKAVLLAGRDPSQFSRPPLDRLVPDLLDRSVKALDVFNAVTNGLDLMHHWQRLAQIAVAALRQITPVGEGQVRRARRALVTLIASMAFDDKEAAATGGGSGGGHGRWAERTRSFGRRIGGAVRDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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