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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001657`

染色体: Chr03 坐标: 21529512-21531719 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001657`
名称	SmilChr03G001657
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	21529512 - 21531719 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015822`
GeneID	`131015822`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015822`
原始查询	`SmilChr03G001657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
产物	ankyrin repeat-containing protein BDA1-like
Arabidopsis	`AT4G10720` (AT4G10720) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826666] identity=32.6; qcov=0.787; evalue=9.43e-56; confidence=low
Rice	`Os02g0735700` - identity=28.6; qcov=0.577; evalue=2.91e-20; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4); PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015822

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800240.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800240.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800240.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800240.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:21529720`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C56
`Chr3:21529720`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C56
`Chr3:21529822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:21530102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B35,D6
`Chr3:21530159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B12,B17,C54
`Chr3:21530228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B12,B17
`Chr3:21530767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D1
`Chr3:21530768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:21530791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr3:21530802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:21530916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C60
`Chr3:21531006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C25,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800240.1

503 aa

252

503

Ank_2

Ank_4

PGG

PF12796 Ank_2 124-184 aa PF12796 Ank_2 184-264 aa PF13637 Ank_4 207-255 aa PF13962 PGG 308-408 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800240.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	124	184	3.2e-22	79.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057800240.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	184	264	3.2e-22	79.6	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057800240.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	207	255	6.5e-12	46.1	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057800240.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	308	408	1.3e-14	54.7	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944257.1
AGGAGGCTAGGCGAGCATAAAAAACAAATAAATATACAACACATCAAATATTTAATTACCTTTACCAGTTGATGAGTCCTTGACACACATGGAAAAAGGGGAAAAACAAGCTAAGCTAGCTTGTGATACACTCATGATGAATTCTTCAAATCCTAAGCTTTGCTCCATGAATGCAAAGTAACCGCGAAAATGGATGGGTGCGATCATGAGTGTGAGTGCAAGAAGAGAAGCGAATACACGGCGACGATAAAGATCTGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015822
ATGGATGGGTGCGATCATGAGTGTGAGTGCAAGAAGAGAAGCGAATACACGGCGACGATAAAGATCTGCGAATGCGAGTGCGATTGCAACTGCGAGTGCTGCATCGACCGCTTCTACTCCGCCATCGAAGACGATCCCAAGCTGCTGCAGAGGCTGGACAAGATCCAGTTCGCCCACACGCCGCTGCACGAGGCGGCGGAGAGTGGGAACACCGTCTTGGCCCTCGAGGTCATGAACCTCATGCCGTCCCTCGCCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800240.1
MDGCDHECECKKRSEYTATIKICECECDCNCECCIDRFYSAIEDDPKLLQRLDKIQFAHTPLHEAAESGNTVLALEVMNLMPSLAKKLNPQGLSPLHLAVVKGNVATALALVKLDSHLVRIKGKAGLTPLHHAAATSHDKCQSELLAGLLVECPESMAVLNNRRQSALHVALENQNVQAARLLVNWLVIVAQESDLSIKDAHGNTTLHVAARYCRCRELLALLTKLVKVNKANNYGETPLDIAIHHRNGDAVEVLKSAGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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