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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001665`

染色体: Chr03 坐标: 21587746-21591221 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001665`
名称	SmilChr03G001665
描述	probable polygalacturonase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	21587746 - 21591221 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015735`
GeneID	`131015735`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015735`
原始查询	`SmilChr03G001665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polygalacturonase
产物	probable polygalacturonase
Arabidopsis	`AT4G23500` (AT4G23500) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828450] identity=76.6; qcov=0.922; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0106800` - identity=65.8; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015735

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057800138.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057800138.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057800138.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800138.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:21588115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C15
`Chr3:21588115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:21588198`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr3:21588198`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr3:21588262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C13,C25,C5
`Chr3:21588300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:21588472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:21590514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:21590713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B83,C59
`Chr3:21590784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C25,C5
`Chr3:21590793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B20,B8,C50,C77
`Chr3:21590813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B66,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800138.1

499 aa

250

499

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 142-445 aa

XP_057800139.1

477 aa

238

477

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 142-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800138.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	142	445	6.7e-33	114.9	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057800139.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	142	423	1.3e-36	127.1	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944156.1
GAAGTGTGGAAGTTATGAAGAGTCAAACTTAAGAAATGTAATTGCTTCTTAAAAAGAATTAATCAAATTTCAAGTTTGGTCTACCTTTTTTATGAGATACACACCAAAAATGGTTACTGGAAATTAAATTTCCCTGATAAAAATAAAAAGAAAAGAGTTAAACAAAATTGGTTTTGTTCTCTTTCGATCCCCAGATCTCTAAAGTCTAAGCAAGCACATTCTCTCTCTCTCCTCGCTCAAATAAATAATGCTCTCTCTCA...

XM_057944155.1
GTTAAACAAAATTGGTTTTGTTCTCTTTCGATCCCCAGATCTCTAAAGTCTAAGCAAGCACATTCTCTCTCTCTCCTCGCTCAAATAAATAATGCTCTCTCTCAAAACACCACCCACACGTCTCCAAACTGCAACGAAAGATGCCCAGAATTCTGGTAATTCACGTGATCTTGGTCCTTGCTGCCACGCTCCCGCTGAGATCAAATGCCGTCCACGGCCACCGTCGTCACGATAACTTCCAGTACTGCGCCATAAGCTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015735
ATGCCCAGAATTCTGGTAATTCACGTGATCTTGGTCCTTGCTGCCACGCTCCCGCTGAGATCAAATGCCGTCCACGGCCACCGTCGTCACGATAACTTCCAGTACTGCGCCATAAGCTGCCGCGCCCACGGCGCATCGCTGACGGATTTCGGAGGCGTCGGAGACGGAACGACCTCGAATACGAGAGCTTTTCAGGCGGCCGTCGATCACCTCGGCCAGTTCGCGGCGTATGGCGGTTCCATGCTCTTCGTTCCGCCGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800138.1
MPRILVIHVILVLAATLPLRSNAVHGHRRHDNFQYCAISCRAHGASLTDFGGVGDGTTSNTRAFQAAVDHLGQFAAYGGSMLFVPPGKWLTGSFNLTSHFTLFLHKDAVLLASQDESEWAVIEPLASYGRGRDTEGGRYISLIFGTNLTDVVITGDNGTIDGQGESWWNKFHKGELQYTRPYLIEIMYSENVQISNLTLVNSPSWNVHPIYSRLTSLTICLGPKISADFVRYICSNVIVQGLTILAPVTSPNTDGINPDS...

XP_057800139.1
MPRILVIHVILVLAATLPLRSNAVHGHRRHDNFQYCAISCRAHGASLTDFGGVGDGTTSNTRAFQAAVDHLGQFAAYGGSMLFVPPGKWLTGSFNLTSHFTLFLHKDAVLLASQDESEWAVIEPLASYGRGRDTEGGRYISLIFGTNLTDVVITGDNGTIDGQGESWWNKFHKGELQYTRPYLIEIMYSENVQISNLTLVNSPSWNVHPIYSSNVIVQGLTILAPVTSPNTDGINPDSCTNTRIEDCYIVSGDDCIAVKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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