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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001684`

染色体: Chr03 坐标: 22222237-22223700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001684`
名称	SmilChr03G001684
描述	uncharacterized SmilChr03G001684
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	22222237 - 22223700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018531`
GeneID	`131018531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018531`
原始查询	`SmilChr03G001684`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=25; qcov=0.296; evalue=8.37e-08; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF09337 (zf-H2C2); PF13456 (RVT_3); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2); PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803231.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803231.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803231.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803231.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803231.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:22222249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A11,B130,B29,B58,B73,B97,C18,C29,C33,C72,D2
`Chr3:22222267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D1
`Chr3:22222267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:22222280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C8,D11,D7
`Chr3:22222298`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C64
`Chr3:22222298`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C64
`Chr3:22222300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	169	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A21,A25,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B110,B111,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B123,B125,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B25,B26,B29,B3,B30,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B7,B70,B73,B74,B76,B78,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B87,B89,B92,B94,B96,B97,B98,B99,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C39,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C65,C66,C69,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D11,D2,D5
`Chr3:22222334`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C62,C81
`Chr3:22222334`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C62,C81
`Chr3:22222351`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A10,A11,A15,B38,B39,B47,B56,C23,C39,C59,C65,C84
`Chr3:22222358`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	69	A14,A19,A24,A25,A6,A9,B102,B110,B111,B112,B115,B118,B120,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B25,B26,B29,B33,B34,B42,B43,B44,B46,B47,B51,B53,B54,B58,B63,B7,B73,B81,B84,B87,B92,C15,C18,C22,C26,C27,C29,C31,C33,C34,C35,C36,C41,C44,C47,C51,C53,C54,C56,C62,C64,C70,C72,C74,C75,C80,C81,D5,D8
`Chr3:22222364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A7,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803231.1

487 aa

244

487

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

RVT_3

Integrase_H2C2

zf-H2C2

PF17919 RT_RNaseH_2 46-144 aa PF17917 RT_RNaseH 73-173 aa PF13456 RVT_3 208-327 aa PF17921 Integrase_H2C2 416-467 aa PF09337 zf-H2C2 428-463 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803231.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	46	144	1.7e-19	70.4	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057803231.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	73	173	5.2e-13	49.8	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057803231.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	208	327	2.2e-15	57.3	Reverse transcriptase-like
`XP_057803231.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	416	467	3.7e-13	50.1	Integrase zinc binding domain
`XP_057803231.1`	Pfam	`PF09337`	zf-H2C2	Domain	428	463	4.2e-06	27.7	H2C2 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947248.1
ATGACAGCACCGCGAAACATTAAAGAAATACAAACACTGAACGGAAGGATAACTGCGCTGAGTCGATTCATATCGAGATCGGTGGAAAGAAGTTTGCCTTTCTTCAAAATTCTAAGGAAAAGAAGCCGGTTCGAATGGAACAATGAGTGCCAACAAGCCTTTGAAGACCTCAAGAACTATCTCAAGGAGCTACCCATCTTAACCAAGCCGGTGCCAGGGGAACCGTTGTATCTATACACTTCAGTGGGGGTAGAATCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018531
ATGACAGCACCGCGAAACATTAAAGAAATACAAACACTGAACGGAAGGATAACTGCGCTGAGTCGATTCATATCGAGATCGGTGGAAAGAAGTTTGCCTTTCTTCAAAATTCTAAGGAAAAGAAGCCGGTTCGAATGGAACAATGAGTGCCAACAAGCCTTTGAAGACCTCAAGAACTATCTCAAGGAGCTACCCATCTTAACCAAGCCGGTGCCAGGGGAACCGTTGTATCTATACACTTCAGTGGGGGTAGAATCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803231.1
MTAPRNIKEIQTLNGRITALSRFISRSVERSLPFFKILRKRSRFEWNNECQQAFEDLKNYLKELPILTKPVPGEPLYLYTSVGVESLSTVLVREERGIQKLIYFVSKIIQGAELRYTAAEKTAYAIMITARKLCPYFLSHKVIVRTALPFQQILGRPDLAGKMVKWAIELGEYDVIFEPRTTIKAQALADFIQETTRWPLRGPWTAQVDGSVTKEGCGVGIYIESPEDGTYQFAIKFKDKLSNNETEYEAVIRAAHILKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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