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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001691`

染色体: Chr03 坐标: 22428933-22429433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001691`
名称	SmilChr03G001691
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g61870, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	22428933 - 22429433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018534`
GeneID	`131018534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018534`
原始查询	`SmilChr03G001691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g61870, mitochondrial-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At1g61870%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G61870` (PPR336) pentatricopeptide repeat 336 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842484] identity=46.3; qcov=1.05; evalue=2.19e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0793200` - identity=42.5; qcov=0.88; evalue=5.43e-24; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057803234.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803234.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803234.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803234.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:22428954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A4,A9,B112,B133,B64,B73,B77,B87,B94,B95,C24,C25,C42,C58,C68,C78,C85,D4
`Chr3:22428971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr3:22428996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:22429040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C73
`Chr3:22429098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,A7,C37
`Chr3:22429110`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A23,A7,C37
`Chr3:22429110`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A23,A7,C37
`Chr3:22429120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:22429155`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr3:22429155`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:22429196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:22429210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947251.1
ATGGCGTTACGCAGCAAGTTCCGATCACTGACCCTCCGGCGCTTCTCCACCTCAATCCTGAGCCCGGACTCCAAAACCCCGCTCACCAGCAAAGAGAAATCGTGTGCCGCCCTCTCCCTCCTCCGCTTCGAGAGCAACCCGGAGCGCGTCCTCGACATCTGCCGCGCCGCCGCCCTCACCCCCAACACGCACCTCGACCGCGTCGCCTACTCGCAGGCCATCACCAAGCTCAAGAAGTCCCATTACTACGAGGGAATCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018534
ATGGCGTTACGCAGCAAGTTCCGATCACTGACCCTCCGGCGCTTCTCCACCTCAATCCTGAGCCCGGACTCCAAAACCCCGCTCACCAGCAAAGAGAAATCGTGTGCCGCCCTCTCCCTCCTCCGCTTCGAGAGCAACCCGGAGCGCGTCCTCGACATCTGCCGCGCCGCCGCCCTCACCCCCAACACGCACCTCGACCGCGTCGCCTACTCGCAGGCCATCACCAAGCTCAAGAAGTCCCATTACTACGAGGGAATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803234.1
MALRSKFRSLTLRRFSTSILSPDSKTPLTSKEKSCAALSLLRFESNPERVLDICRAAALTPNTHLDRVAYSQAITKLKKSHYYEGIRSFITDSLARPDLKSERSVSHFIVLYGQAGLVKDAVKLFEVMRQYGVTQNVKSLNALLISCIMAREYGEMKRTYIVGERD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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