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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001692`

染色体: Chr03 坐标: 22432963-22436773 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001692`
名称	SmilChr03G001692
描述	uncharacterized SmilChr03G001692
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	22432963 - 22436773 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015630`
GeneID	`131015630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015630`
原始查询	`SmilChr03G001692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0166600; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os04g0166600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19330` (AT1G19330) histone deacetylase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838515] identity=54.6; qcov=0.947; evalue=2.39e-67; confidence=high
Rice	`Os04g0166600` - identity=65.5; qcov=1; evalue=1.56e-93; confidence=high
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF13867 (SAP30_Sin3_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800055.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800055.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800055.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800055.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:22435195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr3:22435287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:22435337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800055.1

228 aa

114

228

SAP30_Sin3_bdg

PF13867 SAP30_Sin3_bdg 167-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800055.1`	Pfam	`PF13867`	SAP30_Sin3_bdg	Family	167	220	1.2e-20	74.2	Sin3 binding region of histone deacetylase complex subunit SAP30

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944072.1
AGCCGAGCCACTCCGACCCGTTACCCGCTCAGCCGGTAAGAAAGCGACAAAAAATTAGAAGCAGCGGCCGTACAATTCACTGCAATTTTAGCAGTAGCAGGTCGCTTCCAAATCCACATTCACAAGGCAGTTACTAAAAATTTAGTGTGTGCTCCCTTTCCCCGTCTCTCGCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTGAAACCCGAAAGCACAAACTTTCTCTCTCTTCCAATACTAGCCACCCGCGCTTCAAATTTGATTGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015630
ATGCTGGCAACAGAGTCATGCCCTTCGCGGGTTTTATCTCCTTTACGTGATGAAAGCGGCGATGAAGAGCTGTCTGTTCTTCCCAGGCATACAAAGGTTATAGTCACAGGGAATAACAGAACAAAGAGTGTTTTGGTCGGTTTGCAAGGAGTGGTCAAGAAGGCTGTTGGTCTTGGTGGTTGGCATTGGCTGGTACTGAAGAATGGTGTTGAGGTCAAGCTTCAAAGGAATGCTTTGAGTGTATTAGAACCACCTACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800055.1
MLATESCPSRVLSPLRDESGDEELSVLPRHTKVIVTGNNRTKSVLVGLQGVVKKAVGLGGWHWLVLKNGVEVKLQRNALSVLEPPTGNEEDNEYDFDDSSSGSDMGEKNHRRFSYGLHLSKITKPRVRYNIPWSPSAASTKSMNHGSCREVQSNFCATQLRVNLAKLGTGSLWRYCRSFHLANISSHPTKEQLIKAVQQHFSSQKVDEVQVIVEFIRAAKRLQSVGKD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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