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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr03G001697

染色体: Chr03 坐标: 22520490-22521910 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr03G001697
名称SmilChr03G001697
描述uncharacterized SmilChr03G001697
染色体 / SeqIDChr03 / NC_080389.1
坐标与链方向22520490 - 22521910 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131018537
GeneID131018537
locus_tag-
NCBI NameLOC131018537
原始查询SmilChr03G001697

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
ArabidopsisAT1G06740 (MUG3)
MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669]
identity=28; qcov=0.556; evalue=2.89e-26; confidence=low
RiceOs06g0704400
-
identity=31.2; qcov=0.529; evalue=1.75e-32; confidence=low
GO-
KEGG-
PfamPF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131018537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057803236.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.20000 XP_057803236.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057803236.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057803236.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057803236.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803236.1
437 aa
N
1
218
437
DBD_Tnp_Mut
C
PF03108 DBD_Tnp_Mut 209-264 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057803236.1 Pfam PF03108 DBD_Tnp_Mut Family 209 264 1.4e-08 35.0 MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057947253.1
ATGACTTTAGATAGGATCGTATCTGAATTTGAGGACTGTTATGGTTCTAAACCTAAACTAGTGTATGCGGCAGACGTAGATTATCGCATTGATAAGGGTCTAGTTCCCCTAAGAAATCCTAAACAGTGTCATAAGGTTCTTGATTACCTAGAATTACTTGGCTATGAAGAGATAAATTTATTTGCAGATCATGAAATTGATGTGATGCCTACTTTTGTACCACTTGAGATGTTTTTAGAAGAAGATGAAGTTCTTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131018537
ATGACTTTAGATAGGATCGTATCTGAATTTGAGGACTGTTATGGTTCTAAACCTAAACTAGTGTATGCGGCAGACGTAGATTATCGCATTGATAAGGGTCTAGTTCCCCTAAGAAATCCTAAACAGTGTCATAAGGTTCTTGATTACCTAGAATTACTTGGCTATGAAGAGATAAATTTATTTGCAGATCATGAAATTGATGTGATGCCTACTTTTGTACCACTTGAGATGTTTTTAGAAGAAGATGAAGTTCTTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057803236.1
MTLDRIVSEFEDCYGSKPKLVYAADVDYRIDKGLVPLRNPKQCHKVLDYLELLGYEEINLFADHEIDVMPTFVPLEMFLEEDEVLDKGVENTDAGVQLNDLIGLEEVEGDELPEVEEGERTGIEEGEQGDELPEVEEGERAGIEEGEQGDELPEVEEGERAGIEEGEGRGHGDDENSSVYSECWESDDEVKSLEQLVGSVEGGEEGSFELGMTFAGAKEARESINAYAVKFGYKLKFIKNEKTRIRVVCINDQSCPFLMH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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