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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001727`

染色体: Chr03 坐标: 23217959-23220737 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001727`
名称	SmilChr03G001727
描述	uncharacterized SmilChr03G001727
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	23217959 - 23220737 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015636`
GeneID	`131015636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015636`
原始查询	`SmilChr03G001727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415]; symbol=AT5G62950; hit=AT5G62950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415]; symbol=AT5G62950; hit=AT5G62950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G62950` (AT5G62950) RNA polymerase II, Rpb4, core protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836415] identity=54.4; qcov=0.573; evalue=6.11e-27; confidence=medium
Rice	`Os12g0488800` - identity=49.4; qcov=0.529; evalue=3.38e-18; confidence=low
GO	GO:0000166 (nucleotide binding); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006384 (transcription initiation at RNA polymerase III promoter)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057800062.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800062.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800062.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800062.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800062.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:23218182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:23218183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B136,B36,C32,C55
`Chr3:23218186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:23218194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:23218202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B92,C82
`Chr3:23218208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C84
`Chr3:23218210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B51,C77,D7
`Chr3:23218216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B34,C74
`Chr3:23218220`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B34
`Chr3:23218220`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B34
`Chr3:23218223`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B34
`Chr3:23218223`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944079.1
TTTATTTCTCTAATTTGTTTCAGAGTTGAGGCCAATGTCAGTGCTCTCACTAATTTTGAAGTGCTTGACCTTTTGAGATCAAGAGGTGCTGGAAGGGATGCGTCTCGAGCTATTGCAACCGTATCTCAATCTGAGTTCAAGGTTTTTGATTATCTAGAGGGGACTGTTGCTTGCAATCAAACAAGTAAAATTATTGGTAACTTCGTTGAAGAGTGCCAAAAATTTGACCTGGCCAAGGCAAAGATTCTTAATATAAGACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015636
TTTATTTCTCTAATTTGTTTCAGAGTTGAGGCCAATGTCAGTGCTCTCACTAATTTTGAAGTGCTTGACCTTTTGAGATCAAGAGGTGCTGGAAGGGATGCGTCTCGAGCTATTGCAACCGTATCTCAATCTGAGTTCAAGGTTTTTGATTATCTAGAGGGGACTGTTGCTTGCAATCAAACAAGTAAAATTATTGGTAACTTCGTTGAAGAGTGCCAAAAATTTGACCTGGCCAAGGCAAAGATTCTTAATATAAGACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800062.1
FISLICFRVEANVSALTNFEVLDLLRSRGAGRDASRAIATVSQSEFKVFDYLEGTVACNQTSKIIGNFVEECQKFDLAKAKILNIRPRSEPKLFPGPSSWRMLYSLDMNSDKGILLAADNFGLLYMMSTSRSSRALTSQASASIRRVVSGGYPTGSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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