当前解析结果
SmilChr03G001729| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001729 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001729 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001729 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 23241387 - 23242434 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018541 |
|---|---|
| GeneID | 131018541 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018541 |
| 原始查询 | SmilChr03G001729 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018541 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803241.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057803241.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803241.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803241.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803241.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:23241439 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr3:23241456 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B131,B39,B66 |
Chr3:23241486 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B39 |
Chr3:23241488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A2,A23,A9,B1,B114,B140,B21,B35,B43,B63,C11,C19,C28,C49,C71,D7 |
Chr3:23241500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B131 |
Chr3:23241509 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B131 |
Chr3:23241542 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A18,A21,B109,B131,B38,B39,B66,C13,C39,D10 |
Chr3:23241546 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B66 |
Chr3:23241575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A18,B131,B28 |
Chr3:23241575 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B131,B28 |
Chr3:23241578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A13,C13,C25,C5 |
Chr3:23241578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,C13,C25,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。