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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001731`

染色体: Chr03 坐标: 23261323-23263708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001731`
名称	SmilChr03G001731
描述	uncharacterized SmilChr03G001731
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	23261323 - 23263708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015631`
GeneID	`131015631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015631`
原始查询	`SmilChr03G001731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836588]; symbol=AT5G64670; hit=AT5G64670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836588]; symbol=AT5G64670; hit=AT5G64670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G64670` (AT5G64670) Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836588] identity=59; qcov=0.647; evalue=1.35e-39; confidence=medium
Rice	`Os08g0310100` (Cen8.t00833) - identity=89.5; qcov=0.353; evalue=7.13e-33; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF29471 (Ribosomal_uL15_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800056.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800056.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800056.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800056.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:23261476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C29,C72,D2
`Chr3:23261505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B108,B123,B46,C23
`Chr3:23261943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C53
`Chr3:23261946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr3:23262030`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	201	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A5,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B15,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B42,B44,B45,B46,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B91,B94,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C84,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr3:23262073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B135,B8,C42
`Chr3:23262078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A8,B72
`Chr3:23262078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B72
`Chr3:23262100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr3:23262106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B77
`Chr3:23262180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:23262198`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A2,A4,B108,B118,B127,B3,B47,B73,C41,C47,C56,C76,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800056.1

215 aa

108

215

Ribosomal_uL15_N

PF29471 Ribosomal_uL15_N 115-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800056.1`	Pfam	`PF29471`	Ribosomal_uL15_N	Family	115	149	8.9e-17	61.5	Ribosomal protein uL15, N-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944073.1
CCCAGCCGTGTCGCGACACCGTTGCCTAGGCCCAGCCGACCCTCGACGTCGCCCAAGCTGCCTCGCCGTCGCTCCTGCCTCGATCAATATTGGACATTGTTCTCTTTTGGAGCAAGAGGAATCAATTGTTGTGGAAATGACAAGGAAGATGCTAGGTGATGGGGATCTGGATGAATCTAATGAAGGGGAGGCTCTTTACGACTTCGATTTGTCTGTGATTGGGGCAGGAAGTGGAGGAGTTCGTGCCTCGCGATTCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015631
ATGACAAGGAAGATGCTAGGTGATGGGGATCTGGATGAATCTAATGAAGGGGAGGCTCTTTACGACTTCGATTTGTCTGTGATTGGGGCAGGAAGTGGAGGAGTTCGTGCCTCGCGATTCTCTGCTCAGTATGGAGCTAAGAAAATGTTGGGAAGAAGATTTGGTAGTTTGATGCGAGCTGCCCTAGTTGAATACCCAAGGTTTCCTAGCCCTGAAGCAGCTGGCAGCTTGAAATGTATGTATGATTTAAGCAGTGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800056.1
MTRKMLGDGDLDESNEGEALYDFDLSVIGAGSGGVRASRFSAQYGAKKMLGRRFGSLMRAALVEYPRFPSPEAAGSLKCMYDLSSVRAYSSLLALNDLRDNPGSRQQKTRKGRGIGSGKGKTAGRGHKGQKARGTMKFGFEGGQTPLRRRLPKRGFNNPFSLTFQPLILAVEMIPYALMKGEIHSESPIYLSESINVMRISISGTLAVHGSIEWC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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