当前解析结果
SmilChr03G001736| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001736 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001736 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001736 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 23363616 - 23367449 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015656 |
|---|---|
| GeneID | 131015656 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015656 |
| 原始查询 | SmilChr03G001736 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0166600; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os04g0166600; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G19330 (AT1G19330)histone deacetylase complex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838515] identity=54.6; qcov=0.947; evalue=2.6e-67; confidence=high |
| Rice | Os04g0166600- identity=63.7; qcov=0.991; evalue=1.28e-93; confidence=high |
| GO | GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13867 (SAP30_Sin3_bdg) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015656 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800065.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800065.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800065.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800065.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057800065.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057800065.1PF13867
SAP30_Sin3_bdg 167-220 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057800065.1 |
Pfam | PF13867 |
SAP30_Sin3_bdg | Family | 167 | 220 | 1.2e-20 | 74.2 | Sin3 binding region of histone deacetylase complex subunit SAP30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。