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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001756`

染色体: Chr03 坐标: 23889814-23893119 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001756`
名称	SmilChr03G001756
描述	coatomer subunit beta'-2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	23889814 - 23893119 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015674`
GeneID	`131015674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015674`
原始查询	`SmilChr03G001756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit beta'-2-like
产物	coatomer subunit beta'-2-like
Arabidopsis	`AT1G52360` (AT1G52360) Coatomer, beta' subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841666] identity=81.8; qcov=0.888; evalue=1.06e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0209100` - identity=76.2; qcov=0.938; evalue=1.02e-78; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030117 (membrane coat)
KEGG	-
Pfam	PF04053 (B-prop_COPA_B_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800078.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057800078.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800078.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057800078.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:23890976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C48,C59
`Chr3:23891374`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,B126
`Chr3:23891374`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B10,B126
`Chr3:23891384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B7
`Chr3:23891467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B2,B87,C51
`Chr3:23891486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B24
`Chr3:23891486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr3:23891524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B124,B22
`Chr3:23891890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B135,C24
`Chr3:23891900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C47
`Chr3:23891906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B107,B123
`Chr3:23891932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B36,C30,C63,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800078.1

161 aa

161

B-prop_COPA_B_2nd

PF04053 B-prop_COPA_B_2nd 24-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800078.1`	Pfam	`PF04053`	B-prop_COPA_B_2nd	Repeat	24	128	1.4e-33	117.2	COPA/B second beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098648.1
TGTCTCCCTCTTAATCGCCACTTTTAGCCACTGCTGCGCCGGGATACGCCGTCGACATCTTGTTCGCCGCTTTCAGTCGCCATTGTGCCTTCTACCGAAACCCTATGCATCGATTTTGGTCATCGTGCGGCTCTGCCACCAGAATTCCCAAATTACAAAGCCCTTCTACGGTTAGTGTTCTCGACGTTCCTATCGAAAGCCACATTTGAAGAAGCATAGGTTTTAATACATTATAGAATACCTGTCTAGAGTTGATGTCC...

XM_057944095.1
ACATGTGTCGTACCATATTGAGATTAGAGTGCCTAAAAAAGCATTCAGTTAAATTAACTAACCTGCAGGTGACTTTTCCCATTTTTCTCTTTCCACATTCCGTGCATAAGATGCCTCACCTTCGTATCATTTCGCAGACTTGAAAACACATTGAATTATGGCCTTGAAAGAGTTTGGGCAGTTGGCTACATTAAAGGTTCAAGAAGGGTCGTAATCGGTTATGATGAAGGCACGATCATGGTAAAGCTTGGCCGTGAGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015674
ATGGTAAAGCTTGGCCGTGAGGTACCTGTTGCTAGTATGGACAATGGAGGGAAAATAATTTGGGCCAAGCATAATGAAATTCAGACTGTCAACATCAAGAGTGTTGGGGCAGATTATGAGGTTGCTGATGGAGAGAGATTACCTTTGGCAGTTAAGGAACTGGGAAATTGCGATCTTTATCCACAGAGCTTAAAGCATAATCCCAATGGTAGGTTTGTTGTTGTATGTGGAGATGGTGAATACATAATATACACAGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800078.1
MVKLGREVPVASMDNGGKIIWAKHNEIQTVNIKSVGADYEVADGERLPLAVKELGNCDLYPQSLKHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTALAWRNRSFGSALEFVWSTEGEYAVRESTSKIKIFSKNFQIESESAPNARTEPTAGNSKCSNSCGVYMTSIYVVAL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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